############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data MEDME ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘MEDME/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘MEDME’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘MEDME.rnw’ using Sweave Attaching package: ‘MEDME’ The following object is masked from ‘package:stats’: smooth Error: processing vignette 'MEDME.rnw' failed with diagnostics: chunk 4 (label = MEDMEcpg) Error in library(BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18) : there is no package called ‘BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18’ --- failed re-building ‘MEDME.rnw’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘MEDME.rnw’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted