############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data EnrichmentBrowser ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘EnrichmentBrowser/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘EnrichmentBrowser’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘EnrichmentBrowser.Rmd’ using rmarkdown Quitting from EnrichmentBrowser.Rmd:758-762 [ggea-graph] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `buildEdgeList()`: ! attempt to set index 48/48 in SET_STRING_ELT --- Backtrace: ▆ 1. └─EnrichmentBrowser::ggeaGraph(...) 2. └─EnrichmentBrowser:::.plotGGEAGraph(g, show.scores = show.scores) 3. └─Rgraphviz::layoutGraph(graph) 4. └─Rgraphviz (local) layoutFun(x, ...) 5. └─Rgraphviz::agopen(...) 6. └─Rgraphviz::buildEdgeList(...) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'EnrichmentBrowser.Rmd' failed with diagnostics: attempt to set index 48/48 in SET_STRING_ELT --- failed re-building ‘EnrichmentBrowser.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘EnrichmentBrowser.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted