############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data karyoploteR ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘karyoploteR/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘karyoploteR’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘karyoploteR.Rmd’ using rmarkdown Quitting from karyoploteR.Rmd:314-320 [unnamed-chunk-21] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `options()`: ! invalid 'scipen' --- Backtrace: ▆ 1. └─karyoploteR::kpAddBaseNumbers(kp) 2. └─base::options(scipen = old.scipen) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'karyoploteR.Rmd' failed with diagnostics: invalid 'scipen' --- failed re-building ‘karyoploteR.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘karyoploteR.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted