Back to Workflows build report for BioC 3.8 |
This page was generated on 2019-01-30 16:00:26 -0500 (Wed, 30 Jan 2019).
Version Built a4 1.30.0 3.5.2 a4Base 1.30.0 3.5.2 a4Classif 1.30.0 3.5.2 a4Core 1.30.0 3.5.2 a4Preproc 1.30.0 3.5.2 a4Reporting 1.30.0 3.5.2 ABAData 1.12.0 3.5.2 ABAEnrichment 1.12.0 3.5.2 ABarray 1.50.0 3.5.2 abind 1.4-5 3.5.0 abseqR 1.0.0 3.5.2 ABSSeq 1.36.0 3.5.2 acde 1.12.0 3.5.2 ACE 1.0.0 3.5.2 acepack 1.4.1 3.5.1 aCGH 1.60.0 3.5.2 ACME 2.38.0 3.5.2 actuar 2.3-1 3.5.1 ada 2.0-5 3.5.1 ADaCGH2 2.22.0 3.5.2 adaptest 1.2.0 3.5.2 additivityTests 1.1-4 3.5.1 ade4 1.7-13 3.5.1 adehabitatLT 0.3.23 3.5.1 adehabitatMA 0.3.12 3.5.1 ADGofTest 0.3 3.5.0 adSplit 1.52.0 3.5.2 afex 0.22-1 3.5.1 AffiXcan 1.0.0 3.5.2 affxparser 1.54.0 3.5.2 affy 1.60.0 3.5.2 affycomp 1.58.0 3.5.2 AffyCompatible 1.42.0 3.5.2 affycompData 1.20.0 3.5.2 affyContam 1.40.0 3.5.2 affycoretools 1.54.0 3.5.2 affydata 1.30.0 3.5.2 AffyExpress 1.48.0 3.5.2 Affyhgu133A2Expr 1.18.0 3.5.2 Affyhgu133aExpr 1.20.0 3.5.2 Affyhgu133Plus2Expr 1.16.0 3.5.2 affyILM 1.34.0 3.5.2 affyio 1.52.0 3.5.2 affylmGUI 1.56.0 3.5.2 AffymetrixDataTestFiles 0.20.0 3.5.2 Affymoe4302Expr 1.20.0 3.5.2 affyPara 1.42.0 3.5.2 affypdnn 1.56.0 3.5.2 affyPLM 1.58.0 3.5.2 affyQCReport 1.60.0 3.5.2 AffyRNADegradation 1.28.0 3.5.2 AGDEX 1.30.0 3.5.2 agilp 3.14.0 3.5.2 AgiMicroRna 2.32.0 3.5.2 agricolae 1.3-0 3.5.2 AhoCorasickTrie 0.1.0 3.5.1 AIMS 1.14.1 3.5.2 airway 1.2.0 3.5.2 akima 0.6-2 3.5.1 ALDEx2 1.14.1 3.5.2 aLFQ 1.3.4 3.5.1 AlgDesign 1.1-7.3 3.5.0 ALL 1.24.0 3.5.2 AllelicImbalance 1.20.0 3.5.2 ALLMLL 1.22.0 3.5.2 alluvial 0.1-2 3.5.1 alpine 1.8.0 3.5.2 alpineData 1.8.0 3.5.2 ALS 0.0.6 3.5.0 alsace 1.18.0 3.5.2 altcdfenvs 2.44.0 3.5.2 amap 0.8-16 3.5.0 AMOUNTAIN 1.8.0 3.5.2 AmpAffyExample 1.22.0 3.5.2 amplican 1.4.1 3.5.2 ampliQueso 1.20.0 3.5.2 AnalysisPageServer 1.16.0 3.5.2 anamiR 1.10.0 3.5.2 Anaquin 2.6.1 3.5.2 AneuFinder 1.10.2 3.5.2 AneuFinderData 1.10.0 3.5.2 ANF 1.4.0 3.5.2 animation 2.6 3.5.1 annaffy 1.54.0 3.5.2 annotate 1.60.0 3.5.2 annotation 1.4.0 3.5.2 AnnotationDbi 1.44.0 3.5.2 AnnotationFilter 1.6.0 3.5.2 AnnotationForge 1.24.0 3.5.2 AnnotationFuncs 1.32.0 3.5.2 AnnotationHub 2.14.3 3.5.2 AnnotationHubData 1.12.0 3.5.2 annotationTools 1.56.0 3.5.2 annotatr 1.8.0 3.5.2 anota 1.30.0 3.5.2 anota2seq 1.4.1 3.5.2 antiProfiles 1.22.0 3.5.2 antiProfilesData 1.18.0 3.5.2 aod 1.3.1 3.5.2 apcluster 1.4.7 3.5.1 apComplex 2.48.1 3.5.2 ape 5.2 3.5.1 apeglm 1.4.2 3.5.2 aplpack 1.3.2 3.5.1 appreci8R 1.0.0 3.5.2 argparse 2.0.0 3.5.1 argparser 0.4 3.5.0 ArgumentCheck 0.10.2 3.5.1 arm 1.10-1 3.5.1 aroma.affymetrix 3.1.1 3.5.2 aroma.apd 0.6.0 3.5.1 aroma.core 3.1.3 3.5.1 aroma.light 3.12.0 3.5.2 ArrayExpress 1.42.0 3.5.2 arrayMvout 1.40.0 3.5.2 arrayQuality 1.60.0 3.5.2 arrayQualityMetrics 3.38.0 3.5.2 arrays 1.6.0 3.5.2 ArrayTools 1.42.0 3.5.2 ArrayTV 1.20.0 3.5.2 ARRmData 1.18.0 3.5.2 ARRmNormalization 1.22.0 3.5.2 artMS 1.0.6 3.5.2 arules 1.6-2 3.5.1 ASAFE 1.8.0 3.5.2 ASEB 1.26.0 3.5.2 ASGSCA 1.16.0 3.5.2 ashr 2.2-7 3.5.1 ASICS 1.2.0 3.5.2 ASICSdata 1.2.0 3.5.2 askpass 1.1 3.5.2 ASpli 1.8.1 3.5.2 assertive 0.3-5 3.5.1 assertive.base 0.0-7 3.5.1 assertive.code 0.0-3 3.5.1 assertive.data 0.0-3 3.5.1 assertive.data.uk 0.0-2 3.5.1 assertive.data.us 0.0-2 3.5.1 assertive.datetimes 0.0-2 3.5.1 assertive.files 0.0-2 3.5.1 assertive.matrices 0.0-2 3.5.1 assertive.models 0.0-2 3.5.1 assertive.numbers 0.0-2 3.5.1 assertive.properties 0.0-4 3.5.1 assertive.reflection 0.0-4 3.5.1 assertive.sets 0.0-3 3.5.1 assertive.strings 0.0-3 3.5.1 assertive.types 0.0-3 3.5.1 assertthat 0.2.0 3.5.2 AssessORF 1.0.2 3.5.2 AssessORFData 1.0.0 3.5.2 ASSET 2.0.0 3.5.2 ASSIGN 1.18.0 3.5.2 ATACseqQC 1.6.4 3.5.2 attract 1.34.1 3.5.2 AUCell 1.4.1 3.5.2 aws 2.2-0 3.5.1 awsMethods 1.1-0 3.5.0 BaalChIP 1.8.0 3.5.2 BAC 1.42.0 3.5.2 backports 1.1.3 3.5.1 bacon 1.10.1 3.5.2 BADER 1.20.1 3.5.2 BadRegionFinder 1.10.0 3.5.2 BAGS 2.22.0 3.5.2 ballgown 2.14.1 3.5.2 bamsignals 1.14.0 3.5.2 banocc 1.6.1 3.5.2 base 3.5.2 3.5.2 base64 2.0 3.5.1 base64enc 0.1-3 3.5.0 base64url 1.4 3.5.1 basecallQC 1.6.0 3.5.2 baseline 1.2-1 3.5.1 BaseSpaceR 1.26.0 3.5.2 Basic4Cseq 1.18.1 3.5.2 BASiCS 1.4.1 3.5.2 BasicSTARRseq 1.10.0 3.5.2 BatchJobs 1.7 3.5.1 BatchQC 1.10.1 3.5.2 batchtools 0.9.11 3.5.1 BayesKnockdown 1.8.0 3.5.2 bayesm 3.1-1 3.5.2 BayesPeak 1.34.0 3.5.2 bayNorm 1.0.8 3.5.2 baySeq 2.16.0 3.5.2 bazar 1.0.10 3.5.1 BB 2014.10-1 3.5.1 BBCAnalyzer 1.12.0 3.5.2 BBmisc 1.11 3.5.1 bbmle 1.0.20 3.5.1 bc3net 1.0.4 3.5.1 bcellViper 1.18.0 3.5.2 BCRANK 1.44.0 3.5.2 bcSeq 1.4.1 3.5.2 BDgraph 2.54 3.5.2 BDMMAcorrect 1.0.1 3.5.2 bdsmatrix 1.3-3 3.5.0 beachmat 1.4.0 3.5.2 beadarray 2.32.0 3.5.2 beadarrayExampleData 1.20.0 3.5.2 beadarraySNP 1.48.0 3.5.2 BeadDataPackR 1.34.0 3.5.2 beanplot 1.2 3.5.1 BEARscc 1.2.1 3.5.2 BEAT 1.20.1 3.5.2 BEclear 1.14.0 3.5.2 beeswarm 0.2.3 3.5.0 betareg 3.1-1 3.5.1 bezier 1.1.2 3.5.1 bgafun 1.44.0 3.5.2 BgeeDB 2.8.0 3.5.2 bgmm 1.8.3 3.5.1 bgx 1.48.1 3.5.2 BH 1.69.0-1 3.5.2 BHC 1.34.0 3.5.2 BiasedUrn 1.07 3.5.0 BiBitR 0.3.1 3.5.1 bibtex 0.4.2 3.5.1 BicARE 1.40.0 3.5.2 biclust 2.0.1 3.5.1 BiFET 1.2.1 3.5.2 BiGGR 1.18.0 3.5.2 biglm 0.9-1 3.5.1 bigmelon 1.8.0 3.5.2 bigmemory 4.5.33 3.5.1 bigmemory.sri 0.1.3 3.5.0 bigrquery 1.0.0 3.5.1 bindr 0.1.1 3.5.1 bindrcpp 0.2.2 3.5.1 binom 1.1-1 3.5.1 bio3d 2.3-4 3.5.1 bioassayR 1.20.1 3.5.2 Biobase 2.42.0 3.5.2 biobroom 1.14.0 3.5.2 bioCancer 1.10.0 3.5.2 BiocCaseStudies 1.44.0 3.5.2 BiocCheck 1.18.0 3.5.2 BiocFileCache 1.6.0 3.5.2 BiocGenerics 0.28.0 3.5.2 biocGraph 1.44.0 3.5.2 BiocInstaller 1.32.1 3.5.2 BiocManager 1.30.4 3.5.1 BiocMetaWorkflow 1.2.0 3.5.2 BiocNeighbors 1.0.0 3.5.2 BiocOncoTK 1.2.1 3.5.2 BioCor 1.6.1 3.5.2 BiocParallel 1.16.5 3.5.2 BiocPkgTools 1.0.3 3.5.2 BiocSklearn 1.4.0 3.5.2 BiocStyle 2.10.0 3.5.2 BiocVersion 3.8.0 3.5.2 biocViews 1.50.10 3.5.2 BiocWorkflowTools 1.8.0 3.5.2 bioDist 1.54.0 3.5.2 BioMark 0.4.5 3.5.1 biomaRt 2.38.0 3.5.2 biomformat 1.10.1 3.5.2 BioMVCClass 1.50.0 3.5.2 biomvRCNS 1.22.0 3.5.2 BioNet 1.42.0 3.5.2 bionetdata 1.0.1 3.5.0 BioNetStat 1.2.2 3.5.2 BioQC 1.10.0 3.5.2 BioSeqClass 1.40.0 3.5.2 biosigner 1.10.0 3.5.2 Biostrings 2.50.2 3.5.2 biosvd 2.18.0 3.5.2 biotmle 1.6.0 3.5.2 biotmleData 1.6.0 3.5.2 biovizBase 1.30.1 3.5.2 BiRewire 3.14.0 3.5.2 birta 1.26.0 3.5.2 birte 1.18.0 3.5.2 BiSeq 1.22.0 3.5.2 bit 1.1-14 3.5.2 bit64 0.9-7 3.5.2 bitops 1.0-6 3.5.2 BitSeq 1.26.1 3.5.2 biwt 1.0 3.5.1 bladderbatch 1.20.0 3.5.2 blima 1.16.0 3.5.2 blimaTestingData 1.2.0 3.5.2 BLMA 1.6.0 3.5.2 blob 1.1.1 3.5.2 blockmodeling 0.3.4 3.5.2 BMA 3.18.9 3.5.1 bmp 0.3 3.5.1 bnbc 1.4.0 3.5.2 bnlearn 4.4 3.5.1 bookdown 0.9 3.5.2 BoolNet 2.1.4 3.5.1 boot 1.3-20 3.5.2 bootstrap 2017.2 3.5.0 bpca 1.3-0 3.5.1 BPRMeth 1.8.1 3.5.2 BRAIN 1.28.1 3.5.2 brainImageR 1.0.0 3.5.2 BrainStars 1.26.0 3.5.2 branchpointer 1.8.0 3.5.2 breakpointR 1.0.0 3.5.2 breakpointRdata 1.0.0 3.5.2 breastCancerMAINZ 1.20.0 3.5.2 breastCancerNKI 1.20.0 3.5.2 breastCancerTRANSBIG 1.20.0 3.5.2 breastCancerUNT 1.20.0 3.5.2 breastCancerUPP 1.20.0 3.5.2 breastCancerVDX 1.20.0 3.5.2 brew 1.0-6 3.5.0 brgedata 1.4.0 3.5.2 brglm 0.6.1 3.5.1 bridge 1.46.0 3.5.2 BridgeDbR 1.16.1 3.5.2 broom 0.5.1 3.5.1 BrowserViz 2.4.0 3.5.2 BSgenome 1.50.0 3.5.2 BSgenome.Athaliana.TAIR.TAIR9 1.3.1000 3.5.2 BSgenome.Celegans.UCSC.ce10 1.4.0 3.5.2 BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 1.4.0 3.5.2 BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3 1.4.0 3.5.2 BSgenome.Drerio.UCSC.danRer10 1.4.2 3.5.2 BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7 1.4.0 3.5.2 BSgenome.Ecoli.NCBI.20080805 1.3.1000 3.5.2 BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3 1.4.0 3.5.2 BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5 0.99.1 3.5.2 BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 1.3.1000 3.5.2 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 1.3.1000 3.5.2 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked 1.3.99 3.5.2 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 1.4.0 3.5.2 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked 1.3.99 3.5.2 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 1.4.1 3.5.2 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked 1.3.99 3.5.2 BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 1.4.0 3.5.2 BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked 1.3.99 3.5.2 BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8 1.4.0 3.5.2 BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8.masked 1.3.99 3.5.2 BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9 1.4.0 3.5.2 BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked 1.3.99 3.5.2 BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn5 1.4.0 3.5.2 BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn5.masked 1.3.99 3.5.2 BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn6 1.4.1 3.5.2 BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 1.4.0 3.5.2 BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer2 1.4.0 3.5.2 BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3 1.4.0 3.5.2 bsseq 1.18.0 3.5.2 bsseqData 0.20.0 3.5.2 BubbleTree 2.12.0 3.5.2 BufferedMatrix 1.46.0 3.5.2 BufferedMatrixMethods 1.46.0 3.5.2 BUMHMM 1.6.1 3.5.2 bumphunter 1.24.5 3.5.2 BUS 1.38.0 3.5.2 BUScorrect 1.0.0 3.5.2 c3net 1.1.1 3.5.1 C50 0.1.2 3.5.1 ca 0.71 3.5.1 CAFE 1.18.0 3.5.2 CAGEfightR 1.2.0 3.5.2 CAGEr 1.24.0 3.5.2 Cairo 1.5-9 3.5.0 cairoDevice 2.25 3.5.0 CALIB 1.48.0 3.5.2 calibrate 1.7.2 3.5.1 callr 3.1.1 3.5.2 CAMERA 1.38.1 3.5.2 CAMTHC 1.0.0 3.5.2 canceR 1.16.0 3.5.2 cancerclass 1.26.0 3.5.2 cancerdata 1.20.0 3.5.2 CancerInSilico 2.2.1 3.5.2 CancerMutationAnalysis 1.24.0 3.5.2 CancerSubtypes 1.8.0 3.5.2 CAnD 1.14.0 3.5.2 caOmicsV 1.12.1 3.5.2 capushe 1.1.1 3.5.1 car 3.0-2 3.5.1 carData 3.0-2 3.5.1 Cardinal 2.0.3 3.5.2 caret 6.0-81 3.5.1 caroline 0.7.6 3.5.1 casper 2.16.1 3.5.2 CATALYST 1.6.4 3.5.2 Category 2.48.0 3.5.2 categoryCompare 1.26.0 3.5.2 catnet 1.15.3 3.5.0 caTools 1.17.1.1 3.5.1 CausalR 1.14.1 3.5.2 cba 0.2-19 3.5.1 cbaf 1.4.0 3.5.2 ccaPP 0.3.2 3.5.1 ccdata 1.8.0 3.5.2 ccdrAlgorithm 0.0.5 3.5.1 ccfindR 1.2.1 3.5.2 CCl4 1.20.0 3.5.2 ccmap 1.8.0 3.5.2 CCP 1.1 3.5.0 CCPROMISE 1.8.0 3.5.2 ccrepe 1.18.1 3.5.2 CDFt 1.0.1 3.5.0 celaref 1.0.1 3.5.2 celestial 1.4.6 3.5.1 cellbaseR 1.6.0 3.5.2 cellGrowth 1.26.1 3.5.2 cellHTS2 2.46.1 3.5.2 cellity 1.10.1 3.5.2 CellMapper 1.8.0 3.5.2 CellMapperData 1.8.0 3.5.2 CellNOptR 1.28.1 3.5.2 cellranger 1.1.0 3.5.1 cellscape 1.6.0 3.5.2 CellScore 1.2.0 3.5.2 CellTrails 1.0.1 3.5.2 cellTree 1.12.1 3.5.2 CEMiTool 1.6.10 3.5.2 CexoR 1.20.0 3.5.2 CFAssay 1.16.1 3.5.2 cgdsr 1.2.10 3.5.1 cgdv17 0.20.0 3.5.2 CGEN 3.18.0 3.5.2 CGHbase 1.42.0 3.5.2 CGHcall 2.44.0 3.5.2 cghMCR 1.40.0 3.5.2 CGHnormaliter 1.36.0 3.5.2 CGHregions 1.40.0 3.5.2 ChAMP 2.12.3 3.5.2 ChAMPdata 2.14.1 3.5.2 changepoint 2.2.2 3.5.1 CHARGE 1.2.0 3.5.2 charm 2.28.0 3.5.2 charmData 1.18.0 3.5.2 checkmate 1.9.1 3.5.2 ChemmineDrugs 1.0.2 3.5.2 ChemmineOB 1.20.0 3.5.2 ChemmineR 3.34.1 3.5.2 ChemometricsWithR 0.1.13 3.5.2 Chicago 1.10.1 3.5.2 chimera 1.24.0 3.5.2 chimeraviz 1.8.1 3.5.2 ChIPanalyser 1.4.0 3.5.2 ChIPComp 1.12.0 3.5.2 chipenrich 2.6.1 3.5.2 chipenrich.data 2.6.0 3.5.2 ChIPexoQual 1.6.0 3.5.2 ChIPexoQualExample 1.6.0 3.5.2 ChIPpeakAnno 3.16.1 3.5.2 ChIPQC 1.18.0 3.5.2 ChIPseeker 1.18.0 3.5.2 chipseq 1.32.0 3.5.2 ChIPseqR 1.36.0 3.5.2 ChIPSeqSpike 1.2.1 3.5.2 ChIPsim 1.36.0 3.5.2 chopsticks 1.48.0 3.5.2 chroGPS 2.0.1 3.5.2 chromDraw 2.12.0 3.5.2 ChromHeatMap 1.36.0 3.5.2 chromPlot 1.10.0 3.5.2 chromstaR 1.8.1 3.5.2 chromstaRData 1.8.0 3.5.2 chromswitch 1.4.1 3.5.2 chromVAR 1.4.1 3.5.2 chron 2.3-53 3.5.1 CHRONOS 1.10.0 3.5.2 cicero 1.0.14 3.5.2 CINdex 1.10.0 3.5.2 circlize 0.4.5 3.5.1 CircStats 0.2-6 3.5.1 cisPath 1.22.0 3.5.2 class 7.3-15 3.5.2 ClassifyR 2.2.5 3.5.2 classInt 0.3-1 3.5.1 cleanUpdTSeq 1.20.0 3.5.2 cleaver 1.20.0 3.5.2 cli 1.0.1 3.5.1 clinfun 1.0.15 3.5.1 clippda 1.32.0 3.5.2 clipper 1.22.0 3.5.2 clipr 0.5.0 3.5.2 clisymbols 1.2.0 3.5.1 CLL 1.22.0 3.5.2 Clomial 1.18.1 3.5.2 Clonality 1.30.0 3.5.2 clonotypeR 1.20.0 3.5.2 clst 1.30.0 3.5.2 clstutils 1.30.0 3.5.2 clue 0.3-56 3.5.1 clues 0.5.9 3.5.1 clustComp 1.10.0 3.5.2 cluster 2.0.7-1 3.5.2 clusterCrit 1.2.8 3.5.1 clusterExperiment 2.2.0 3.5.2 ClusterJudge 1.4.0 3.5.2 clusterProfiler 3.10.1 3.5.2 ClusterR 1.1.8 3.5.2 clusterSeq 1.6.0 3.5.2 ClusterSignificance 1.10.0 3.5.2 clusterSim 0.47-3 3.5.1 clusterStab 1.54.0 3.5.2 clValid 0.6-6 3.5.1 CMA 1.40.0 3.5.2 cMAP 1.15.1 3.5.2 cMap2data 1.18.0 3.5.2 cmprsk 2.2-7 3.5.1 cn.farms 1.30.0 3.5.2 cn.mops 1.28.0 3.5.2 CNAnorm 1.28.0 3.5.2 CNEr 1.18.1 3.5.2 CNORdt 1.24.1 3.5.2 CNORfeeder 1.22.1 3.5.2 CNORfuzzy 1.24.0 3.5.2 CNORode 1.24.1 3.5.2 CNPBayes 1.12.0 3.5.2 CNTools 1.38.0 3.5.2 cnvGSA 1.26.0 3.5.2 cnvGSAdata 1.18.0 3.5.2 CNVPanelizer 1.14.0 3.5.2 CNVrd2 1.20.0 3.5.2 CNVtools 1.76.0 3.5.2 cobindR 1.20.0 3.5.2 cobs 1.3-3 3.5.1 CoCiteStats 1.54.0 3.5.2 COCOA 1.0.1 3.5.2 coda 0.19-2 3.5.1 codelink 1.50.0 3.5.2 codetools 0.2-16 3.5.2 CODEX 1.14.1 3.5.2 coexnet 1.4.0 3.5.2 CoGAPS 3.2.2 3.5.2 cogena 1.16.0 3.5.2 coGPS 1.26.0 3.5.2 COHCAP 1.28.1 3.5.2 COHCAPanno 1.18.0 3.5.2 coin 1.2-2 3.5.1 colonCA 1.24.0 3.5.2 colorRamps 2.3 3.5.0 colorspace 1.4-0 3.5.2 colortools 0.1.5 3.5.0 colourpicker 1.0 3.5.1 combinat 0.0-8 3.5.0 coMET 1.14.0 3.5.2 cometExactTest 0.1.5 3.5.1 commonmark 1.7 3.5.1 compartmap 1.0.3 3.5.2 COMPASS 1.20.1 3.5.2 compcodeR 1.18.1 3.5.2 compEpiTools 1.16.0 3.5.2 CompGO 1.18.0 3.5.2 compiler 3.5.2 3.5.2 ComplexHeatmap 1.20.0 3.5.2 compositions 1.40-2 3.5.1 CompQuadForm 1.4.3 3.5.0 condcomp 1.0.1 3.5.2 CONFESS 1.10.1 3.5.2 CONFESSdata 1.10.0 3.5.2 consensus 1.0.2 3.5.2 ConsensusClusterPlus 1.46.0 3.5.2 consensusDE 1.0.5 3.5.2 consensusOV 1.4.1 3.5.2 consensusSeekeR 1.10.0 3.5.2 contiBAIT 1.10.1 3.5.2 contrast 0.21 3.5.1 convert 1.58.0 3.5.2 copa 1.50.0 3.5.2 copula 0.999-19 3.5.2 CopyhelpeR 1.14.0 3.5.2 copynumber 1.22.0 3.5.2 CopywriteR 2.14.1 3.5.2 coRdon 1.0.3 3.5.2 CoRegNet 1.20.0 3.5.2 Cormotif 1.28.0 3.5.2 CorMut 1.24.0 3.5.2 corpcor 1.6.9 3.5.0 CORREP 1.48.0 3.5.2 corrgram 1.13 3.5.1 corrplot 0.84 3.5.1 coseq 1.6.1 3.5.2 COSMIC.67 1.18.0 3.5.2 cosmiq 1.16.1 3.5.2 COSNet 1.16.0 3.5.2 CountClust 1.10.1 3.5.2 countsimQC 1.0.1 3.5.2 covEB 1.8.1 3.5.2 covr 3.2.1 3.5.1 covRNA 1.8.0 3.5.2 cowplot 0.9.4 3.5.2 CoxBoost 1.4 3.5.1 cp4p 0.3.5 3.5.1 CPE 1.5.1 3.5.1 cpvSNP 1.14.0 3.5.2 cqn 1.28.1 3.5.2 crayon 1.3.4 3.5.2 CRImage 1.30.0 3.5.2 CRISPRseek 1.22.1 3.5.2 crisprseekplus 1.8.0 3.5.2 CrispRVariants 1.10.1 3.5.2 crlmm 1.40.0 3.5.2 crossmeta 1.8.0 3.5.2 crosstalk 1.0.0 3.5.1 crul 0.7.0 3.5.2 CSAR 1.34.0 3.5.2 csaw 1.16.1 3.5.2 CSSP 1.20.0 3.5.2 ctc 1.56.0 3.5.2 CTDquerier 1.2.0 3.5.2 cTRAP 1.0.3 3.5.2 ctsGE 1.8.1 3.5.2 cubature 2.0.3 3.5.1 Cubist 0.2.2 3.5.1 cummeRbund 2.24.0 3.5.2 curatedBladderData 1.18.0 3.5.2 curatedMetagenomicData 1.12.3 3.5.2 curatedOvarianData 1.20.0 3.5.2 curatedTCGAData 1.4.0 3.5.2 curl 3.3 3.5.2 customProDB 1.22.1 3.5.2 cvAUC 1.1.0 3.5.1 CVE 1.8.0 3.5.2 cvTools 0.3.2 3.5.1 cycle 1.36.0 3.5.2 cydar 1.6.1 3.5.2 CytoDx 1.2.1 3.5.2 cytofkit 1.14.0 3.5.2 cytofWorkflow 1.4.1 3.5.2 cytolib 1.4.1 3.5.2 CytoML 1.8.1 3.5.2 d3heatmap 0.6.1.2 3.5.1 d3Network 0.5.2.1 3.5.1 dada2 1.10.1 3.5.2 dagitty 0.2-2 3.5.1 dagLogo 1.20.0 3.5.2 daMA 1.54.0 3.5.2 DaMiRseq 1.6.2 3.5.2 DAPAR 1.14.4 3.5.2 DAPARdata 1.12.1 3.5.2 DART 1.30.0 3.5.2 data.table 1.12.0 3.5.2 datasets 3.5.2 3.5.2 DBChIP 1.26.0 3.5.2 DBI 1.0.0 3.5.2 dbplyr 1.3.0 3.5.2 dcGSA 1.10.1 3.5.2 DChIPRep 1.12.0 3.5.2 ddCt 1.38.0 3.5.2 ddPCRclust 1.2.0 3.5.2 DDRTree 0.1.5 3.5.1 debrowser 1.10.7 3.5.2 DECIPHER 2.10.1 3.5.2 DEComplexDisease 1.2.0 3.5.2 DeconRNASeq 1.24.0 3.5.2 decontam 1.2.1 3.5.2 DEDS 1.56.0 3.5.2 DeepBlueR 1.8.0 3.5.2 deepSNV 1.28.0 3.5.2 DEFormats 1.10.1 3.5.2 DEGreport 1.18.1 3.5.2 DEGseq 1.36.1 3.5.2 Delaporte 6.3.0 3.5.1 DelayedArray 0.8.0 3.5.2 DelayedMatrixStats 1.4.0 3.5.2 deldir 0.1-16 3.5.2 deltaGseg 1.22.0 3.5.2 DeMAND 1.12.0 3.5.2 dendextend 1.9.0 3.5.1 dendsort 0.3.3 3.5.1 densityClust 0.3 3.5.1 DEoptimR 1.0-8 3.5.0 DEP 1.4.1 3.5.2 depmixS4 1.3-5 3.5.1 DEqMS 1.0.1 3.5.2 derfinder 1.16.1 3.5.2 derfinderData 2.0.0 3.5.2 derfinderHelper 1.16.1 3.5.2 derfinderPlot 1.16.1 3.5.2 desc 1.2.0 3.5.1 DEScan2 1.2.1 3.5.2 DescTools 0.99.27 3.5.2 DESeq 1.34.1 3.5.2 DESeq2 1.22.2 3.5.2 DEsingle 1.2.1 3.5.2 deSolve 1.21 3.5.0 destiny 2.12.0 3.5.2 DEsubs 1.8.1 3.5.2 devtools 2.0.1 3.5.1 DEXSeq 1.28.1 3.5.2 dexus 1.22.1 3.5.2 DFP 1.40.0 3.5.2 diagram 1.6.4 3.5.0 DiagrammeR 1.0.0 3.5.1 DiagrammeRsvg 0.1 3.5.1 dichromat 2.0-0 3.5.0 DiffBind 2.10.0 3.5.2 diffcoexp 1.2.0 3.5.2 DiffCorr 0.4.1 3.5.1 diffcyt 1.2.8 3.5.2 diffGeneAnalysis 1.64.0 3.5.2 diffHic 1.14.0 3.5.2 DiffLogo 2.6.0 3.5.2 diffloop 1.10.0 3.5.2 diffloopdata 1.10.0 3.5.2 diffobj 0.2.1 3.5.2 diffr 0.1 3.5.1 diffusr 0.1.4 3.5.1 diffuStats 1.2.0 3.5.2 digest 0.6.18 3.5.2 diggit 1.14.0 3.5.2 diggitdata 1.14.0 3.5.2 diptest 0.75-7 3.5.0 Director 1.8.0 3.5.2 DirichletMultinomial 1.24.1 3.5.2 discordant 1.6.1 3.5.2 discretecdAlgorithm 0.0.5 3.5.1 DiscriMiner 0.1-29 3.5.1 distillery 1.0-4 3.5.0 distr 2.7.0 3.5.1 distrEx 2.7.0 3.5.1 dks 1.28.0 3.5.2 DLBCL 1.22.0 3.5.2 DMCHMM 1.4.0 3.5.2 DMRcaller 1.14.1 3.5.2 DMRcate 1.18.0 3.5.2 DMRcatedata 1.18.0 3.5.2 DMRforPairs 1.18.0 3.5.2 DMRScan 1.8.0 3.5.2 dmrseq 1.2.2 3.5.2 dmt 0.8.20 3.5.1 DMwR 0.4.1 3.5.1 DNABarcodes 1.12.0 3.5.2 DNAcopy 1.56.0 3.5.2 DNAshapeR 1.10.0 3.5.2 dnet 1.1.4 3.5.1 DO.db 2.9 3.5.2 doBy 4.6-2 3.5.1 docopt 0.6.1 3.5.1 doFuture 0.7.0 3.5.2 DominoEffect 1.2.0 3.5.2 doParallel 1.0.14 3.5.1 doppelgangR 1.10.1 3.5.2 DOQTL 1.18.0 3.5.2 doRNG 1.7.1 3.5.1 Doscheda 1.4.1 3.5.2 DOSE 3.8.2 3.5.2 doSNOW 1.0.16 3.5.1 dotCall64 1.0-0 3.5.1 downloader 0.4 3.5.1 dplyr 0.7.8 3.5.1 DPpackage 1.1-7.4 3.5.1 drawProteins 1.2.0 3.5.2 drc 3.0-1 3.5.1 DRIMSeq 1.10.1 3.5.2 DriverNet 1.22.0 3.5.2 DropletUtils 1.2.2 3.5.2 drosgenome1.db 3.2.3 3.5.2 drosophila2probe 2.18.0 3.5.2 DrugVsDisease 2.24.2 3.5.2 DrugVsDiseasedata 1.18.0 3.5.2 dSimer 1.8.0 3.5.2 DSS 2.30.1 3.5.2 DT 0.5 3.5.1 DTA 2.28.0 3.5.2 dtw 1.20-1 3.5.1 dualKS 1.42.0 3.5.2 DupChecker 1.20.0 3.5.2 dyebias 1.42.0 3.5.2 dyebiasexamples 1.22.0 3.5.2 dynamicTreeCut 1.63-1 3.5.0 DynDoc 1.60.0 3.5.2 e1071 1.7-0.1 3.5.2 earth 4.7.0 3.5.2 EasyqpcR 1.24.0 3.5.2 easyRNASeq 2.18.3 3.5.2 EBarrays 2.46.0 3.5.2 EBcoexpress 1.26.0 3.5.2 ebdbNet 1.2.5 3.5.1 EBImage 4.24.0 3.5.2 EBSEA 1.10.0 3.5.2 EBSeq 1.22.1 3.5.2 EBSeqHMM 1.16.1 3.5.2 ecolicdf 2.18.0 3.5.2 ecoliLeucine 1.22.0 3.5.2 ecolitk 1.54.0 3.5.2 ecp 3.1.0 3.5.1 EDASeq 2.16.3 3.5.2 EDDA 1.20.1 3.5.2 edge 2.14.0 3.5.2 edgeR 3.24.3 3.5.2 eegc 1.8.1 3.5.2 EGAD 1.10.0 3.5.2 egg 0.4.2 3.5.1 EGSEA 1.10.1 3.5.2 EGSEA123 1.4.1 3.5.2 EGSEAdata 1.10.0 3.5.2 eiR 1.22.0 3.5.2 eisa 1.34.0 3.5.2 ELBOW 1.18.1 3.5.2 ellipse 0.4.1 3.5.1 ELMER 2.6.1 3.5.2 ELMER.data 2.6.0 3.5.2 emdbook 1.3.10 3.5.1 emdist 0.3-1 3.5.0 EMDomics 2.12.0 3.5.2 emmeans 1.3.2 3.5.2 emojifont 0.5.2 3.5.1 EmpiricalBrownsMethod 1.10.0 3.5.2 EMT 1.1 3.5.0 ENCODExplorer 2.8.0 3.5.2 energy 1.7-5 3.5.1 EnhancedVolcano 1.0.1 3.5.2 ENmix 1.18.1 3.5.2 EnrichedHeatmap 1.12.0 3.5.2 EnrichmentBrowser 2.12.1 3.5.2 enrichplot 1.2.0 3.5.2 enrichR 1.0 3.5.1 EnsDb.Hsapiens.v75 2.99.0 3.5.2 EnsDb.Hsapiens.v79 2.99.0 3.5.2 EnsDb.Hsapiens.v86 2.99.0 3.5.2 EnsDb.Mmusculus.v79 2.99.0 3.5.2 ensembldb 2.6.4 3.5.2 ensurer 1.1 3.5.1 entropy 1.2.1 3.5.0 enviPat 2.2 3.5.0 ENVISIONQuery 1.30.0 3.5.2 EnvStats 2.3.1 3.5.1 Epi 2.32 3.5.1 EpiDISH 1.4.1 3.5.2 epigenomix 1.22.0 3.5.2 epiNEM 1.6.0 3.5.2 epivizr 2.12.0 3.5.2 epivizrChart 1.4.0 3.5.2 epivizrData 1.10.0 3.5.2 epivizrServer 1.10.0 3.5.2 epivizrStandalone 1.10.0 3.5.2 eQTL 1.4.0 3.5.2 erccdashboard 1.16.1 3.5.2 erma 0.14.0 3.5.2 ERSSA 1.0.1 3.5.2 esATAC 1.4.2 3.5.2 esetVis 1.8.0 3.5.2 estimability 1.3 3.5.0 estrogen 1.28.0 3.5.2 etec16s 1.10.0 3.5.2 etm 1.0.4 3.5.1 etrunct 0.1 3.5.1 eudysbiome 1.12.0 3.5.2 eulerr 5.0.0 3.5.1 europepmc 0.3 3.5.1 evaluate 0.12 3.5.2 evd 2.3-3 3.5.1 EventPointer 2.0.1 3.5.2 evmix 2.11 3.5.1 exactRankTests 0.8-29 3.5.1 ExiMiR 2.24.0 3.5.2 exomeCopy 1.28.0 3.5.2 exomePeak 2.16.0 3.5.2 ExperimentHub 1.8.0 3.5.2 ExperimentHubData 1.8.0 3.5.2 expint 0.1-5 3.5.0 explorase 1.46.0 3.5.2 expm 0.999-3 3.5.1 ExPosition 2.8.23 3.5.2 ExpressionAtlas 1.10.0 3.5.2 ExpressionNormalizationWorkflow 1.6.1 3.5.2 ExpressionView 1.34.0 3.5.2 extrafont 0.17 3.5.0 extrafontdb 1.0 3.5.0 extRemes 2.0-9 3.5.1 extremevalues 2.3.2 3.5.1 faahKO 1.22.0 3.5.2 fabia 2.28.0 3.5.2 facopy.annot 1.2.0 3.5.2 factDesign 1.58.0 3.5.2 factoextra 1.0.5 3.5.1 FactoMineR 1.41 3.5.1 FamAgg 1.10.0 3.5.2 fansi 0.4.0 3.5.1 FANTOM3and4CAGE 1.18.0 3.5.2 farms 1.34.0 3.5.2 farver 1.1.0 3.5.1 fastcluster 1.1.25 3.5.0 fastICA 1.2-1 3.5.1 fastLiquidAssociation 1.18.0 3.5.2 fastmatch 1.1-0 3.5.0 FastqCleaner 1.0.0 3.5.2 fastseg 1.28.0 3.5.2 fBasics 3042.89 3.5.1 FCBF 1.0.1 3.5.2 fCCAC 1.8.0 3.5.2 fCI 1.12.0 3.5.2 FD 1.0-12 3.5.1 fda 2.4.8 3.5.1 FDb.InfiniumMethylation.hg18 2.2.0 3.5.2 FDb.InfiniumMethylation.hg19 2.2.0 3.5.2 FDb.UCSC.tRNAs 1.0.1 3.5.2 fdrame 1.54.0 3.5.2 fdrtool 1.2.15 3.5.0 feather 0.3.2 3.5.2 feature 1.2.13 3.5.1 FELLA 1.2.0 3.5.2 FEM 3.10.0 3.5.2 ff 2.2-14 3.5.1 ffbase 0.12.7 3.5.1 FField 0.1.0 3.5.1 ffpe 1.26.0 3.5.2 ffpeExampleData 1.20.0 3.5.2 fftwtools 0.9-8 3.5.0 FGNet 3.16.0 3.5.2 fgsea 1.8.0 3.5.2 fibroEset 1.24.0 3.5.2 fields 9.6 3.5.1 filehash 2.4-1 3.5.0 filematrix 1.3 3.5.1 FindMyFriends 1.12.0 3.5.2 findpython 1.0.4 3.5.1 fingerprint 3.5.7 3.5.1 FIs 1.10.0 3.5.2 FISHalyseR 1.16.0 3.5.2 fission 1.2.0 3.5.2 fit.models 0.5-14 3.5.1 fitdistrplus 1.0-14 3.5.2 FitHiC 1.8.0 3.5.2 flagme 1.38.1 3.5.2 flashClust 1.01-2 3.5.0 Fletcher2013a 1.18.0 3.5.2 Fletcher2013b 1.18.0 3.5.2 flexclust 1.4-0 3.5.1 flexdashboard 0.5.1.1 3.5.1 flexmix 2.3-14 3.5.1 flipflop 1.20.0 3.5.2 flowAI 1.12.3 3.5.2 flowBeads 1.20.1 3.5.2 flowBin 1.18.1 3.5.2 flowcatchR 1.16.0 3.5.2 flowCHIC 1.16.1 3.5.2 flowCL 1.20.1 3.5.2 flowClean 1.20.0 3.5.2 flowClust 3.20.1 3.5.2 flowCore 1.48.1 3.5.2 flowCyBar 1.18.1 3.5.2 flowDensity 1.16.1 3.5.2 flowFit 1.20.1 3.5.2 flowFitExampleData 1.18.0 3.5.2 flowFP 1.40.1 3.5.2 flowMap 1.20.1 3.5.2 flowMatch 1.18.1 3.5.2 flowMeans 1.42.1 3.5.2 flowMerge 2.30.1 3.5.2 flowPeaks 1.28.1 3.5.2 flowPloidy 1.8.0 3.5.2 flowPloidyData 1.8.0 3.5.2 flowPlots 1.30.1 3.5.2 flowQB 2.10.1 3.5.2 flowQBData 1.8.0 3.5.2 FlowRepositoryR 1.14.1 3.5.2 FlowSOM 1.14.1 3.5.2 FlowSorted.Blood.450k 1.20.0 3.5.2 FlowSorted.CordBloodNorway.450k 1.8.0 3.5.2 flowStats 3.40.1 3.5.2 flowTime 1.6.1 3.5.2 flowTrans 1.34.1 3.5.2 flowType 2.20.1 3.5.2 flowUtils 1.46.1 3.5.2 flowViz 1.46.1 3.5.2 flowVS 1.14.1 3.5.2 flowWorkspace 3.30.2 3.5.2 flowWorkspaceData 2.18.0 3.5.2 fmcsR 1.24.0 3.5.2 fmsb 0.6.3 3.5.0 FNN 1.1.2.2 3.5.1 focalCall 1.16.0 3.5.2 FoldGO 1.0.1 3.5.2 fontBitstreamVera 0.1.1 3.5.0 fontLiberation 0.1.0 3.5.0 fontquiver 0.2.1 3.5.1 forcats 0.3.0 3.5.1 foreach 1.4.4 3.5.1 foreign 0.8-71 3.5.2 formatR 1.5 3.5.2 Formula 1.2-3 3.5.0 formula.tools 1.7.1 3.5.1 FourCSeq 1.16.0 3.5.2 fpc 2.1-11.1 3.5.1 freetypeharfbuzz 0.2.5 3.5.2 FRGEpistasis 1.18.0 3.5.2 frma 1.34.0 3.5.2 frmaExampleData 1.18.0 3.5.2 frmaTools 1.34.0 3.5.2 fs 1.2.6 3.5.1 FSelector 0.31 3.5.1 FunChIP 1.8.0 3.5.2 FunciSNP 1.26.0 3.5.2 FunciSNP.data 1.18.0 3.5.2 functional 0.6 3.5.0 funtooNorm 1.6.0 3.5.2 futile.logger 1.4.3 3.5.2 futile.options 1.0.1 3.5.2 future 1.11.1.1 3.5.2 future.apply 1.1.0 3.5.2 GA 3.2 3.5.2 GA4GHclient 1.6.0 3.5.2 GA4GHshiny 1.4.0 3.5.2 gaga 2.28.1 3.5.2 gage 2.32.1 3.5.2 gageData 2.20.0 3.5.2 gaggle 1.50.0 3.5.2 gaia 2.26.0 3.5.2 gam 1.16 3.5.1 gamlss 5.1-2 3.5.1 gamlss.data 5.1-0 3.5.1 gamlss.dist 5.1-1 3.5.1 gap 1.1-22 3.5.1 GAprediction 1.8.1 3.5.2 garfield 1.10.0 3.5.2 GARS 1.2.0 3.5.2 GateFinder 1.2.1 3.5.2 gatingMLData 2.22.0 3.5.2 gaucho 1.18.0 3.5.2 gbm 2.1.5 3.5.2 gbRd 0.4-11 3.5.0 gcapc 1.6.0 3.5.2 gcatest 1.12.0 3.5.2 gclus 1.3.2 3.5.2 gCrisprTools 1.10.1 3.5.2 gcrma 2.54.0 3.5.2 gcspikelite 1.20.0 3.5.2 gdata 2.18.0 3.5.1 GDCRNATools 1.2.1 3.5.2 GDSArray 1.2.0 3.5.2 gdsfmt 1.18.1 3.5.2 gdtools 0.1.7 3.5.1 geecc 1.16.1 3.5.2 geeM 0.10.1 3.5.1 geepack 1.2-1 3.5.0 GEM 1.8.0 3.5.2 genalg 0.2.0 3.5.0 genArise 1.58.0 3.5.2 genbankr 1.10.0 3.5.2 GeneAccord 1.0.0 3.5.2 GeneAnswers 2.24.0 3.5.2 geneAttribution 1.8.0 3.5.2 GeneBreak 1.12.0 3.5.2 geneClassifiers 1.6.0 3.5.2 GeneExpressionSignature 1.28.0 3.5.2 genefilter 1.64.0 3.5.2 genefu 2.14.0 3.5.2 GeneGeneInteR 1.8.0 3.5.2 geneLenDataBase 1.18.0 3.5.2 GeneMeta 1.54.0 3.5.2 GeneNet 1.2.13 3.5.0 GeneNetworkBuilder 1.24.0 3.5.2 GeneOverlap 1.18.0 3.5.2 geneplast 1.8.0 3.5.2 geneplotter 1.60.0 3.5.2 geneRecommender 1.54.0 3.5.2 GeneRegionScan 1.38.0 3.5.2 generegulation 1.4.0 3.5.2 generics 0.0.2 3.5.1 geneRxCluster 1.18.0 3.5.2 GeneSelectMMD 2.26.0 3.5.2 GeneSelector 2.32.0 3.5.2 GENESIS 2.12.2 3.5.2 GeneStructureTools 1.2.1 3.5.2 geNetClassifier 1.22.0 3.5.2 genetics 1.3.8.1 3.5.1 GeneticsDesign 1.50.0 3.5.2 GeneticsPed 1.44.0 3.5.2 geneXtendeR 1.8.0 3.5.2 GENIE3 1.4.0 3.5.2 GenKern 1.2-60 3.5.1 genoCN 1.34.0 3.5.2 GenoGAM 2.0.2 3.5.2 genomation 1.14.0 3.5.2 genomationData 1.14.0 3.5.2 GenomeGraphs 1.42.0 3.5.2 GenomeInfoDb 1.18.1 3.5.2 GenomeInfoDbData 1.2.0 3.5.2 genomeIntervals 1.38.0 3.5.2 genomes 3.12.0 3.5.2 genomewidesnp5Crlmm 1.0.6 3.5.2 genomewidesnp6Crlmm 1.0.7 3.5.2 GenomicAlignments 1.18.1 3.5.2 GenomicDataCommons 1.6.0 3.5.2 GenomicFeatures 1.34.3 3.5.2 GenomicFiles 1.18.0 3.5.2 GenomicInteractions 1.16.0 3.5.2 GenomicRanges 1.34.0 3.5.2 GenomicScores 1.6.0 3.5.2 GenomicTuples 1.16.0 3.5.2 Genominator 1.36.0 3.5.2 genoset 1.38.0 3.5.2 genotypeeval 1.14.0 3.5.2 GenRank 1.10.0 3.5.2 GenSA 1.1.7 3.5.0 GenVisR 1.14.1 3.5.2 GeoDE 1.0 3.5.1 GEOmap 2.4-4 3.5.1 GEOmetadb 1.44.0 3.5.2 geometry 0.3-6 3.5.1 GEOquery 2.50.5 3.5.2 GEOsubmission 1.34.0 3.5.2 gep2pep 1.2.0 3.5.2 gespeR 1.14.1 3.5.2 getopt 1.20.2 3.5.2 GetoptLong 0.1.7 3.5.1 GeuvadisTranscriptExpr 1.10.0 3.5.2 geuvPack 1.14.0 3.5.2 geuvStore2 1.12.0 3.5.2 GEWIST 1.26.0 3.5.2 GFA 1.0.3 3.5.0 GGally 1.4.0 3.5.1 GGBase 3.44.0 3.5.2 ggbeeswarm 0.6.0 3.5.1 ggbio 1.30.0 3.5.2 ggcorrplot 0.1.2 3.5.1 ggcyto 1.10.2 3.5.2 GGdata 1.20.0 3.5.2 ggdendro 0.1-20 3.5.1 ggExtra 0.8 3.5.1 ggforce 0.1.3 3.5.1 ggfortify 0.4.5 3.5.1 ggimage 0.2.1 3.5.2 ggm 2.3 3.5.1 ggmcmc 1.1.1 3.5.2 ggnetwork 0.5.1 3.5.1 ggplot2 3.1.0 3.5.1 ggplotify 0.0.3 3.5.1 ggpmisc 0.3.0 3.5.1 ggpubr 0.2 3.5.1 ggraph 1.0.2 3.5.1 ggrepel 0.8.0 3.5.1 ggridges 0.5.1 3.5.1 ggsci 2.9 3.5.1 ggseqlogo 0.1 3.5.1 ggsignif 0.4.0 3.5.1 ggthemes 4.0.1 3.5.1 GGtools 5.18.0 3.5.2 ggtree 1.14.6 3.5.2 ggvis 0.4.4 3.5.1 gh 1.0.1 3.5.1 GIGSEA 1.0.0 3.5.2 girafe 1.34.0 3.5.2 GISPA 1.6.0 3.5.2 gistr 0.4.2 3.5.1 git2r 0.24.0 3.5.2 GLAD 2.46.0 3.5.2 glasso 1.10 3.5.1 Glimma 1.10.1 3.5.2 glm2 1.2.1 3.5.1 glmnet 2.0-16 3.5.1 glmSparseNet 1.0.0 3.5.2 GlobalAncova 4.0.0 3.5.2 GlobalOptions 0.1.0 3.5.1 globals 0.12.4 3.5.1 globalSeq 1.10.1 3.5.2 globaltest 5.36.0 3.5.2 glue 1.3.0 3.5.2 gmm 1.6-2 3.5.1 gmodels 2.18.1 3.5.1 gmp 0.5-13.2 3.5.1 GMRP 1.10.1 3.5.2 GO.db 3.7.0 3.5.2 GOexpress 1.16.1 3.5.2 goftest 1.1-1 3.5.0 GOfuncR 1.2.0 3.5.2 GOFunction 1.30.0 3.5.2 golubEsets 1.24.0 3.5.2 googleAuthR 0.7.0 3.5.1 GoogleGenomics 2.4.0 3.5.2 googleVis 0.6.3 3.5.1 GOpro 1.8.0 3.5.2 goProfiles 1.44.0 3.5.2 goric 1.1-0 3.5.1 GOSemSim 2.8.0 3.5.2 goseq 1.34.1 3.5.2 GOSim 1.20.0 3.5.2 goSTAG 1.6.1 3.5.2 GOstats 2.48.0 3.5.2 GOsummaries 2.18.0 3.5.2 GOTHiC 1.18.1 3.5.2 goTools 1.56.0 3.5.2 gower 0.1.2 3.5.1 gpart 1.0.0 3.5.2 gplots 3.0.1.1 3.5.2 gpls 1.54.0 3.5.2 gprege 1.26.0 3.5.2 gProfileR 0.6.7 3.5.1 gptk 1.08 3.5.1 gQTLBase 1.14.0 3.5.2 gQTLstats 1.14.0 3.5.2 gRain 1.3-0 3.5.1 graph 1.60.0 3.5.2 GraphAlignment 1.46.0 3.5.2 GraphAT 1.54.0 3.5.2 graphics 3.5.2 3.5.2 graphite 1.28.2 3.5.2 GraphPAC 1.24.0 3.5.2 grasp2db 1.1.0 3.5.2 gRbase 1.8-3.4 3.5.1 grDevices 3.5.2 3.5.2 GRENITS 1.34.0 3.5.2 GreyListChIP 1.14.0 3.5.2 grid 3.5.2 3.5.2 gridBase 0.4-7 3.5.1 gridExtra 2.3 3.5.1 gridGraphics 0.3-0 3.5.1 gridSVG 1.6-0 3.5.1 grImport 0.9-1.1 3.5.2 GRmetrics 1.8.1 3.5.2 grndata 1.14.0 3.5.2 groHMM 1.16.0 3.5.2 grr 0.9.5 3.5.0 GRridge 1.6.0 3.5.2 GSA 1.03 3.5.0 GSALightning 1.10.0 3.5.2 GSAR 1.16.0 3.5.2 GSBenchMark 1.2.0 3.5.2 GSCA 2.12.0 3.5.2 GSE62944 1.10.0 3.5.2 GSEABase 1.44.0 3.5.2 GSEABenchmarkeR 1.2.1 3.5.2 GSEAlm 1.42.0 3.5.2 gsean 1.2.0 3.5.2 gsl 1.9-10.3 3.5.0 gsmoothr 0.1.7 3.5.0 GSReg 1.16.0 3.5.2 GSRI 2.30.0 3.5.2 gss 2.1-9 3.5.0 gsubfn 0.7 3.5.1 GSVA 1.30.0 3.5.2 GSVAdata 1.18.0 3.5.2 gtable 0.2.0 3.5.1 gtools 3.8.1 3.5.0 gtrellis 1.14.0 3.5.2 GUIDEseq 1.12.1 3.5.2 Guitar 1.20.1 3.5.2 Gviz 1.26.4 3.5.2 gwascat 2.14.0 3.5.2 GWASdata 1.20.0 3.5.2 GWASExactHW 1.01 3.5.0 GWASTools 1.28.0 3.5.2 gwasurvivr 1.0.0 3.5.2 gWidgets 0.0-54.1 3.5.2 gWidgets2 1.0-7 3.5.1 gWidgets2RGtk2 1.0-7 3.5.1 gWidgetsRGtk2 0.0-86 3.5.1 gWidgetstcltk 0.0-55 3.5.1 h5vc 2.16.0 3.5.2 h5vcData 2.2.0 3.5.2 hapFabia 1.24.0 3.5.2 haplo.stats 1.7.9 3.5.1 hapmap100kxba 1.24.0 3.5.2 hapmapsnp5 1.24.0 3.5.2 hapmapsnp6 1.24.0 3.5.2 HardyWeinberg 1.6.1 3.5.1 Harman 1.10.0 3.5.2 HarmanData 1.10.0 3.5.2 HarmonizedTCGAData 1.4.0 3.5.2 Harshlight 1.54.0 3.5.2 hash 2.2.6 3.5.1 hashmap 0.2.2 3.5.1 haven 2.0.0 3.5.1 HDCytoData 1.2.10 3.5.2 HDF5Array 1.10.1 3.5.2 hdf5r 1.0.1 3.5.1 HDTD 1.16.0 3.5.2 healthyFlowData 1.20.0 3.5.2 heatmap.plus 1.3 3.5.0 heatmap3 1.1.1 3.5.1 heatmaply 0.15.2 3.5.1 heatmaps 1.6.0 3.5.2 Heatplus 2.28.0 3.5.2 HEEBOdata 1.20.0 3.5.2 HelloRanges 1.8.0 3.5.2 HelloRangesData 1.8.0 3.5.2 HELP 1.40.0 3.5.2 HEM 1.54.0 3.5.2 hexbin 1.27.2 3.5.1 hgfocuscdf 2.18.0 3.5.2 hgfocusprobe 2.18.0 3.5.2 hgu133a.db 3.2.3 3.5.2 hgu133a2.db 3.2.3 3.5.2 hgu133acdf 2.18.0 3.5.2 hgu133afrmavecs 1.5.0 3.5.2 hgu133aprobe 2.18.0 3.5.2 hgu133atagcdf 2.18.0 3.5.2 hgu133atagprobe 2.18.0 3.5.2 hgu133plus2.db 3.2.3 3.5.2 hgu133plus2cdf 2.18.0 3.5.2 hgu133plus2CellScore 1.2.0 3.5.2 hgu133plus2probe 2.18.0 3.5.2 hgu95a.db 3.2.3 3.5.2 hgu95acdf 2.18.0 3.5.2 hgu95av2 2.2.0 3.5.2 hgu95av2.db 3.2.3 3.5.2 hgu95av2cdf 2.18.0 3.5.2 hgu95av2probe 2.18.0 3.5.2 hgug4112a.db 3.2.3 3.5.2 HH 3.1-35 3.5.1 hiAnnotator 1.16.0 3.5.2 HIBAG 1.18.1 3.5.2 HiCBricks 1.0.0 3.5.2 HiCcompare 1.4.0 3.5.2 HiCDataHumanIMR90 1.2.0 3.5.2 HiCDataLymphoblast 1.18.0 3.5.2 hicrep 1.6.0 3.5.2 hierGWAS 1.12.0 3.5.2 hierinf 1.0.0 3.5.2 highcharter 0.7.0 3.5.2 highlight 0.4.7.2 3.5.0 highr 0.7 3.5.2 HilbertCurve 1.12.0 3.5.2 HilbertVis 1.40.0 3.5.2 HilbertVisGUI 1.40.0 3.5.2 hipathia 1.3.1 3.5.2 HIREewas 1.0.2 3.5.2 HiTC 1.26.0 3.5.2 HiveR 0.3.42 3.5.1 hmdbQuery 1.2.0 3.5.2 Hmisc 4.2-0 3.5.2 HMMcopy 1.24.0 3.5.2 hms 0.4.2 3.5.2 hom.Dm.inp.db 3.1.2 3.5.2 hom.Hs.inp.db 3.1.2 3.5.2 hom.Mm.inp.db 3.1.2 3.5.2 hom.Rn.inp.db 3.1.2 3.5.2 hom.Sc.inp.db 3.1.2 3.5.2 Homo.sapiens 1.3.1 3.5.2 hopach 2.42.0 3.5.2 howmany 0.3-1 3.5.0 HPAanalyze 1.0.0 3.5.2 hpar 1.24.0 3.5.2 HSMMSingleCell 1.2.0 3.5.2 htmlTable 1.13.1 3.5.2 htmltools 0.3.6 3.5.1 HTMLUtils 0.1.7 3.5.1 htmlwidgets 1.3 3.5.1 HTqPCR 1.36.0 3.5.2 HTSanalyzeR 2.34.1 3.5.2 HTSCluster 2.0.8 3.5.1 htSeqTools 1.30.0 3.5.2 HTSFilter 1.22.1 3.5.2 httpcode 0.2.0 3.5.0 httptest 3.2.2 3.5.1 httpuv 1.4.5.1 3.5.2 httr 1.4.0 3.5.2 hu6800.db 3.2.3 3.5.2 huge 1.2.7 3.5.1 hugene10sttranscriptcluster.db 8.7.0 3.5.2 human.db0 3.7.1 3.5.2 human370v1cCrlmm 1.0.2 3.5.2 human610quadv1bCrlmm 1.0.3 3.5.2 HumanAffyData 1.8.0 3.5.2 humanCHRLOC 2.1.6 3.5.2 humanStemCell 0.22.0 3.5.2 hunspell 3.0 3.5.1 hwriter 1.3.2 3.5.0 HybridMTest 1.26.0 3.5.2 hyperdraw 1.34.0 3.5.2 hypergea 1.3.6 3.5.1 hypergraph 1.54.0 3.5.2 iASeq 1.26.1 3.5.2 iasva 1.0.1 3.5.2 iBBiG 1.26.0 3.5.2 ibh 1.30.0 3.5.2 iBMQ 1.22.0 3.5.2 ic.infer 1.1-6 3.5.1 iC10 1.4.2 3.5.1 iC10TrainingData 1.3.1 3.5.1 ica 1.0-2 3.5.0 iCARE 1.10.3 3.5.2 Icens 1.54.0 3.5.2 icetea 1.0.1 3.5.2 iCheck 1.12.0 3.5.2 iChip 1.36.0 3.5.2 iCluster 2.1.0 3.5.1 iClusterPlus 1.18.0 3.5.2 iCNV 1.2.1 3.5.2 iCOBRA 1.10.0 3.5.2 ICS 1.3-1 3.5.1 ICSNP 1.1-1 3.5.1 ideal 1.6.1 3.5.2 IdeoViz 1.18.0 3.5.2 idiogram 1.58.0 3.5.2 IdMappingAnalysis 1.26.0 3.5.2 IdMappingRetrieval 1.30.0 3.5.2 IDPmisc 1.1.18 3.5.1 idr 1.2 3.5.0 ifultools 2.0-4 3.5.1 iGC 1.12.0 3.5.2 igraph 1.2.2 3.5.1 igraphdata 1.0.1 3.5.1 igvR 1.2.0 3.5.2 IHW 1.10.1 3.5.2 Illumina450ProbeVariants.db 1.18.0 3.5.2 IlluminaDataTestFiles 1.20.0 3.5.2 IlluminaHumanMethylation27kanno.ilmn12.hg19 0.6.0 3.5.2 IlluminaHumanMethylation27kmanifest 0.4.0 3.5.2 IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 0.6.0 3.5.2 IlluminaHumanMethylation450kmanifest 0.4.0 3.5.2 IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19 0.6.0 3.5.2 IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b4.hg19 0.6.0 3.5.2 IlluminaHumanMethylationEPICmanifest 0.3.0 3.5.2 illuminaHumanv1.db 1.26.0 3.5.2 illuminaHumanv3.db 1.26.0 3.5.2 illuminaHumanv4.db 1.26.0 3.5.2 illuminaio 0.24.0 3.5.2 imageHTS 1.32.1 3.5.2 IMAS 1.6.1 3.5.2 Imetagene 1.12.0 3.5.2 IMMAN 1.2.0 3.5.2 ImmuneSpaceR 1.10.2 3.5.2 immunoClust 1.14.1 3.5.2 imp4p 0.7 3.5.1 IMPCdata 1.18.0 3.5.2 import 1.1.0 3.5.1 ImpulseDE 1.8.0 3.5.2 ImpulseDE2 1.6.1 3.5.2 impute 1.56.0 3.5.2 imputeLCMD 2.0 3.5.1 INDEED 1.0.1 3.5.2 ineq 0.2-13 3.5.0 influenceR 0.1.0 3.5.1 infotheo 1.2.0 3.5.0 ini 0.3.1 3.5.1 inline 0.3.15 3.5.1 InPAS 1.14.1 3.5.2 INPower 1.18.0 3.5.2 INSPEcT 1.12.1 3.5.2 InTAD 1.2.1 3.5.2 intansv 1.22.0 3.5.2 InteractionSet 1.10.0 3.5.2 interactiveDisplay 1.20.0 3.5.2 interactiveDisplayBase 1.20.0 3.5.2 IntEREst 1.6.1 3.5.2 intergraph 2.0-2 3.5.1 InterMineR 1.4.1 3.5.2 intervals 0.15.1 3.5.0 IntramiRExploreR 1.4.0 3.5.2 inum 1.0-0 3.5.1 InvariantCausalPrediction 0.7-2 3.5.1 inveRsion 1.30.0 3.5.2 IONiseR 2.6.0 3.5.2 iPAC 1.26.0 3.5.2 ipdDb 1.0.0 3.5.2 IPO 1.8.1 3.5.2 IPPD 1.30.0 3.5.2 ipred 0.9-8 3.5.1 IRanges 2.16.0 3.5.2 IrisSpatialFeatures 1.6.0 3.5.2 irlba 2.3.2 3.5.1 irr 0.84.1 3.5.2 isa2 0.3.5 3.5.1 iSEE 1.2.1 3.5.2 iSeq 1.34.0 3.5.2 ismev 1.42 3.5.1 Iso 0.0-17 3.5.0 isobar 1.28.1 3.5.2 IsoCorrectoR 1.0.5 3.5.2 IsoformSwitchAnalyzeR 1.4.0 3.5.2 IsoGene 1.0-24 3.5.1 IsoGeneGUI 2.18.0 3.5.2 ISoLDE 1.10.1 3.5.2 isomiRs 1.10.1 3.5.2 isva 1.9 3.5.1 ITALICS 2.42.0 3.5.2 ITALICSData 2.20.0 3.5.2 iterativeBMA 1.40.0 3.5.2 iterativeBMAsurv 1.40.0 3.5.2 iterators 1.0.10 3.5.1 iterClust 1.4.0 3.5.2 iteremoval 1.2.0 3.5.2 itertools 0.1-3 3.5.1 IVAS 2.2.1 3.5.2 ivygapSE 1.4.0 3.5.2 IWTomics 1.6.0 3.5.2 jackstraw 1.3 3.5.1 JADE 2.0-1 3.5.1 JASPAR2014 1.18.0 3.5.2 JASPAR2016 1.10.0 3.5.2 JASPAR2018 1.1.1 3.5.2 JctSeqData 1.12.0 3.5.2 joda 1.30.0 3.5.2 jomo 2.6-6 3.5.2 jpeg 0.1-8 3.5.0 jsonlite 1.6 3.5.2 JunctionSeq 1.12.1 3.5.2 kableExtra 1.0.1 3.5.2 kappalab 0.4-7 3.5.1 karyoploteR 1.8.5 3.5.2 KCsmart 2.40.0 3.5.2 kebabs 1.16.0 3.5.2 KEGG.db 3.2.3 3.5.2 KEGGandMetacoreDzPathwaysGEO 1.2.0 3.5.2 KEGGdzPathwaysGEO 1.20.0 3.5.2 KEGGgraph 1.42.0 3.5.2 KEGGlincs 1.8.0 3.5.2 keggorthology 2.34.0 3.5.2 KEGGprofile 1.24.0 3.5.2 KEGGREST 1.22.0 3.5.2 kernlab 0.9-27 3.5.1 KernSmooth 2.23-15 3.5.2 kimisc 0.4 3.5.1 kimod 1.10.0 3.5.2 kinship2 1.6.4 3.5.1 KinSwingR 1.0.3 3.5.2 kissDE 1.2.0 3.5.2 kknn 1.3.1 3.5.1 klaR 0.6-14 3.5.1 km.ci 0.5-2 3.5.1 KMsurv 0.1-5 3.5.0 knitcitations 1.0.8 3.5.1 knitr 1.21 3.5.2 knitrBootstrap 1.0.2 3.5.1 KOdata 1.8.0 3.5.2 kohonen 3.0.8 3.5.1 kpmt 0.1.0 3.5.1 ks 1.11.3 3.5.1 kza 4.1.0 3.5.1 labeling 0.3 3.5.0 labelled 2.0.2 3.5.2 laeken 0.5.0 3.5.2 lambda.r 1.2.3 3.5.2 LaplacesDemon 16.1.1 3.5.1 lapmix 1.48.0 3.5.2 lars 1.2 3.5.0 lasso2 1.2-20 3.5.1 lassoshooting 0.1.5-1 3.5.0 later 0.7.5 3.5.1 lattice 0.20-38 3.5.2 latticeExtra 0.6-28 3.5.1 lava 1.6.4 3.5.1 lavaan 0.6-3 3.5.1 lazyeval 0.2.1 3.5.1 LBE 1.50.0 3.5.2 ldblock 1.12.0 3.5.2 LEA 2.4.0 3.5.2 leaps 3.0 3.5.1 LearnBayes 2.15.1 3.5.0 learnr 0.9.2.1 3.5.1 LedPred 1.16.0 3.5.2 leeBamViews 1.18.0 3.5.2 les 1.32.0 3.5.2 leukemiasEset 1.18.0 3.5.2 levi 1.0.0 3.5.2 lfa 1.12.0 3.5.2 libcoin 1.0-2 3.5.1 LiblineaR 2.10-8 3.5.0 liftOver 1.4.0 3.5.2 LIM 1.4.6 3.5.1 limma 3.38.3 3.5.2 limmaGUI 1.58.0 3.5.2 limSolve 1.5.5.3 3.5.1 LINC 1.10.0 3.5.2 LineagePulse 1.2.1 3.5.2 linkcomm 1.0-11 3.5.1 Linnorm 2.6.1 3.5.2 lintr 1.0.3 3.5.1 LiquidAssociation 1.36.0 3.5.2 listenv 0.7.0 3.5.1 listviewer 2.1.0 3.5.1 lmdme 1.24.0 3.5.2 lme4 1.1-19 3.5.1 lmerTest 3.0-1 3.5.1 LMGene 2.38.0 3.5.2 Lmoments 1.2-3 3.5.0 lmtest 0.9-36 3.5.1 LOBSTAHS 1.8.1 3.5.2 locfdr 1.1-8 3.5.0 locfit 1.5-9.1 3.5.1 loci2path 1.2.0 3.5.2 log4r 0.2 3.5.1 logging 0.9-106 3.5.2 logicFS 2.2.0 3.5.2 LogicReg 1.5.10 3.5.1 logistf 1.23 3.5.1 logitT 1.40.0 3.5.2 Logolas 1.6.0 3.5.2 logspline 2.1.11 3.5.0 lokern 1.1-8 3.5.1 lol 1.30.0 3.5.2 LOLA 1.12.0 3.5.2 longitudinal 1.1.12 3.5.0 loo 2.0.0 3.5.1 LoomExperiment 1.0.2 3.5.2 loose.rock 1.0.9 3.5.1 LowMACA 1.12.0 3.5.2 LowMACAAnnotation 0.99.3 3.5.2 LPE 1.56.0 3.5.2 LPEadj 1.42.0 3.5.2 lpNet 2.14.0 3.5.2 lpSolve 5.6.13 3.5.0 lpSolveAPI 5.5.2.0-17 3.5.0 lpsymphony 1.10.0 3.5.2 LRBaseDbi 1.0.0 3.5.2 lsa 0.73.1 3.5.1 LSD 4.0-0 3.5.0 lsei 1.2-0 3.5.0 lsmeans 2.30-0 3.5.1 lsr 0.5 3.5.0 lubridate 1.7.4 3.5.1 lumi 2.34.0 3.5.2 lumiBarnes 1.22.0 3.5.2 lumiHumanAll.db 1.22.0 3.5.2 lumiHumanIDMapping 1.10.1 3.5.2 LungCancerACvsSCCGEO 1.18.0 3.5.2 LungCancerLines 0.20.0 3.5.2 lungExpression 0.20.0 3.5.2 LVSmiRNA 1.32.0 3.5.2 lydata 1.8.0 3.5.2 LymphoSeq 1.10.0 3.5.2 LymphoSeqDB 0.99.2 3.5.2 M3C 1.4.1 3.5.2 M3D 1.16.0 3.5.2 M3DExampleData 1.8.0 3.5.2 M3Drop 1.8.1 3.5.2 maanova 1.52.0 3.5.2 macat 1.56.0 3.5.2 maCorrPlot 1.52.0 3.5.2 MACPET 1.2.0 3.5.2 made4 1.56.0 3.5.2 MADSEQ 1.8.0 3.5.2 maEndToEnd 2.0.0 3.5.2 MafDb.1Kgenomes.phase1.hs37d5 3.7.1 3.5.2 MafDb.1Kgenomes.phase3.hs37d5 3.7.0 3.5.2 MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137.hs37d5 3.7.0 3.5.2 MafDb.ExAC.r1.0.hs37d5 3.7.0 3.5.2 MafDb.gnomADex.r2.0.1.hs37d5 3.8.0 3.5.2 maftools 1.8.0 3.5.2 MAGeCKFlute 1.2.2 3.5.2 magic 1.5-9 3.5.1 magicaxis 2.0.4 3.5.1 magick 2.0 3.5.1 magrittr 1.5 3.5.2 maigesPack 1.46.0 3.5.2 MAIT 1.16.1 3.5.2 makecdfenv 1.58.0 3.5.2 MALDIquant 1.18 3.5.1 manipulate 1.0.1 3.5.0 manipulateWidget 0.10.0 3.5.1 MANOR 1.54.0 3.5.2 manta 1.28.1 3.5.2 MantelCorr 1.52.0 3.5.2 mapdata 2.3.0 3.5.1 mAPKL 1.12.0 3.5.2 mAPKLData 1.14.0 3.5.2 mapplots 1.5.1 3.5.1 mapproj 1.2.6 3.5.1 maPredictDSC 1.20.0 3.5.2 maps 3.3.0 3.5.1 mapscape 1.6.0 3.5.2 maptools 0.9-4 3.5.1 maptpx 1.9-2 3.5.1 maptree 1.4-7 3.5.1 maqcExpression4plex 1.26.0 3.5.2 MAQCsubset 1.20.0 3.5.2 MAQCsubsetAFX 1.20.0 3.5.2 markdown 0.9 3.5.2 marray 1.60.0 3.5.2 martini 1.2.0 3.5.2 maser 1.0.0 3.5.2 maSigPro 1.54.0 3.5.2 maskBAD 1.26.0 3.5.2 MASS 7.3-51.1 3.5.2 MassArray 1.34.1 3.5.2 massiR 1.18.0 3.5.2 MassSpecWavelet 1.48.1 3.5.2 MAST 1.8.2 3.5.2 matchBox 1.24.0 3.5.2 Matching 4.9-3 3.5.1 matlab 1.0.2 3.5.0 Matrix 1.2-15 3.5.2 Matrix.utils 0.9.7 3.5.1 matrixcalc 1.0-3 3.5.0 MatrixModels 0.4-1 3.5.1 MatrixRider 1.14.0 3.5.2 matrixStats 0.54.0 3.5.2 matter 1.8.3 3.5.2 MaxContrastProjection 1.6.1 3.5.2 maxLik 1.3-4 3.5.1 maxstat 0.7-25 3.5.1 MBA 0.0-9 3.5.1 MBAmethyl 1.16.0 3.5.2 MBASED 1.16.0 3.5.2 MBCB 1.36.0 3.5.2 mboost 2.9-1 3.5.1 mBPCR 1.36.0 3.5.2 MBttest 1.10.0 3.5.2 mcaGUI 1.30.0 3.5.2 MCbiclust 1.6.1 3.5.2 mcbiopi 1.1.6 3.5.1 MCL 1.0 3.5.1 mclust 5.4.2 3.5.1 mcmc 0.9-5 3.5.1 MCMCglmm 2.26 3.5.1 MCMCpack 1.4-4 3.5.1 MCRestimate 2.38.0 3.5.2 mCSEA 1.2.1 3.5.2 mCSEAdata 1.2.0 3.5.2 mdgsa 1.14.0 3.5.2 mdp 1.2.1 3.5.2 mdqc 1.44.0 3.5.2 MDTS 1.2.0 3.5.2 MEAL 1.12.0 3.5.2 MeasurementError.cor 1.54.0 3.5.2 MEDIPS 1.34.0 3.5.2 MEDIPSData 1.18.0 3.5.2 MEDME 1.42.0 3.5.2 MEEBOdata 1.20.0 3.5.2 mefa 3.2-7 3.5.1 MEIGOR 1.16.0 3.5.2 memoise 1.1.0 3.5.2 memuse 4.0-0 3.5.0 MergeMaid 2.54.0 3.5.2 Mergeomics 1.10.0 3.5.2 MeSH.Aca.eg.db 1.11.0 3.5.2 MeSH.AOR.db 1.11.0 3.5.2 MeSH.Bsu.168.eg.db 1.11.0 3.5.2 MeSH.Cel.eg.db 1.11.0 3.5.2 MeSH.db 1.11.0 3.5.2 MeSH.Hsa.eg.db 1.11.0 3.5.2 MeSH.PCR.db 1.11.0 3.5.2 MeSH.Syn.eg.db 1.11.0 3.5.2 MeSHDbi 1.18.0 3.5.2 meshes 1.8.0 3.5.2 meshr 1.18.0 3.5.2 MESS 0.5.5 3.5.2 messina 1.18.0 3.5.2 metaArray 1.60.0 3.5.2 Metab 1.16.1 3.5.2 metabomxtr 1.16.1 3.5.2 MetaboSignal 1.12.0 3.5.2 metaCCA 1.10.0 3.5.2 MetaCyto 1.4.1 3.5.2 metafor 2.0-0 3.5.1 metagene 2.14.0 3.5.2 metagenomeFeatures 2.2.1 3.5.2 metagenomeSeq 1.24.1 3.5.2 metahdep 1.40.0 3.5.2 metaMA 3.1.2 3.5.1 metaMS 1.18.1 3.5.2 metaMSdata 1.18.0 3.5.2 MetaNeighbor 1.2.1 3.5.2 metap 1.0 3.5.1 metaSeq 1.22.1 3.5.2 metaseqR 1.22.1 3.5.2 metavizr 1.6.1 3.5.2 MetCirc 1.12.1 3.5.2 methimpute 1.4.1 3.5.2 methInheritSim 1.4.1 3.5.2 methods 3.5.2 3.5.2 MethPed 1.10.1 3.5.2 MethTargetedNGS 1.14.0 3.5.2 methVisual 1.34.0 3.5.2 methyAnalysis 1.24.0 3.5.2 MethylAid 1.16.0 3.5.2 MethylAidData 1.14.0 3.5.2 methylationArrayAnalysis 1.4.0 3.5.2 methylGSA 1.0.2 3.5.2 methylInheritance 1.6.1 3.5.2 methylKit 1.8.1 3.5.2 MethylMix 2.12.0 3.5.2 methylMnM 1.20.0 3.5.2 methylPipe 1.16.0 3.5.2 MethylSeekR 1.22.0 3.5.2 methylumi 2.28.0 3.5.2 methyvim 1.4.0 3.5.2 methyvimData 1.4.0 3.5.2 MetID 1.0.0 3.5.2 MetNet 1.0.1 3.5.2 mfa 1.4.1 3.5.2 Mfuzz 2.42.0 3.5.2 mgcv 1.8-26 3.5.2 MGFM 1.16.0 3.5.2 MGFR 1.8.1 3.5.2 mgsa 1.30.0 3.5.2 mGSZ 1.0 3.5.1 mhsmm 0.4.16 3.5.0 mi 1.0 3.5.1 mice 3.3.0 3.5.1 MiChip 1.36.0 3.5.2 microbenchmark 1.4-6 3.5.1 microbiome 1.4.2 3.5.2 microRNA 1.40.0 3.5.2 MIGSA 1.6.0 3.5.2 MIGSAdata 1.6.0 3.5.2 mimager 1.6.0 3.5.2 mime 0.6 3.5.2 MIMOSA 1.20.1 3.5.2 MineICA 1.22.0 3.5.2 minet 3.40.0 3.5.2 minfi 1.28.3 3.5.2 minfiData 0.28.0 3.5.2 minfiDataEPIC 1.8.0 3.5.2 MinimumDistance 1.26.0 3.5.2 minionSummaryData 1.12.0 3.5.2 miniUI 0.1.1.1 3.5.1 minpack.lm 1.2-1 3.5.1 minqa 1.2.4 3.5.1 MiPP 1.54.0 3.5.2 MIRA 1.4.1 3.5.2 MiRaGE 1.24.1 3.5.2 mirbase.db 1.2.0 3.5.2 miRBaseConverter 1.6.0 3.5.2 miRBaseVersions.db 1.1.0 3.5.2 miRcomp 1.12.0 3.5.2 miRcompData 1.12.0 3.5.2 mirIntegrator 1.12.0 3.5.2 miRLAB 1.12.0 3.5.2 miRmine 1.4.0 3.5.2 mirna10cdf 2.18.0 3.5.2 miRNAmeConverter 1.10.0 3.5.2 miRNApath 1.42.0 3.5.2 miRNAtap 1.16.0 3.5.2 miRNAtap.db 0.99.10 3.5.2 miRNATarget 1.20.0 3.5.2 miRSM 1.0.0 3.5.2 miRsponge 1.8.0 3.5.2 Mirsynergy 1.18.0 3.5.2 misc3d 0.8-4 3.5.1 miscTools 0.6-22 3.5.1 missForest 1.4 3.5.1 missMethyl 1.16.0 3.5.2 missRows 1.2.0 3.5.2 mitml 0.3-7 3.5.2 mitoODE 1.20.1 3.5.2 mitoODEdata 1.18.0 3.5.2 mixOmics 6.6.1 3.5.2 mixsmsn 1.1-5 3.5.0 mixtools 1.1.0 3.5.1 mlbench 2.1-1 3.5.1 MLInterfaces 1.62.0 3.5.2 mlm4omics 1.0.1 3.5.2 mlogit 0.3-0 3.5.1 MLP 1.30.0 3.5.2 mlr 2.13 3.5.1 MLSeq 2.0.1 3.5.2 MMDiff2 1.10.0 3.5.2 MMDiffBamSubset 1.18.0 3.5.2 MmPalateMiRNA 1.32.0 3.5.2 mnlogit 1.2.5 3.5.1 mnormt 1.5-5 3.5.0 MODA 1.8.0 3.5.2 modeest 2.3.2 3.5.1 ModelMetrics 1.2.2 3.5.1 modelr 0.1.2 3.5.1 modeltools 0.2-22 3.5.1 modes 0.7.0 3.5.0 mogene10sttranscriptcluster.db 8.7.0 3.5.2 mogsa 1.16.0 3.5.2 moments 0.14 3.5.0 mongolite 2.0 3.5.1 monocle 2.10.1 3.5.2 MoonlightR 1.8.0 3.5.2 MoPS 1.16.0 3.5.2 mosaics 2.20.0 3.5.2 mosaicsExample 1.20.0 3.5.2 motifbreakR 1.12.0 3.5.2 motifcounter 1.6.0 3.5.2 MotifDb 1.24.1 3.5.2 motifmatchr 1.4.0 3.5.2 motifRG 1.26.0 3.5.2 motifStack 1.26.0 3.5.2 MotIV 1.38.0 3.5.2 mouse4302.db 3.2.3 3.5.2 MPFE 1.18.0 3.5.2 mpm 1.0-22 3.5.1 mpmi 0.42 3.5.1 mppa 1.0 3.5.0 mpra 1.4.1 3.5.2 MPRAnalyze 1.0.1 3.5.2 mQTL 1.0 3.5.1 mRMRe 2.0.7 3.5.1 msa 1.14.0 3.5.2 msd16s 1.2.0 3.5.2 msdata 0.22.0 3.5.2 msgbsR 1.6.1 3.5.2 MSGFgui 1.16.1 3.5.2 MSGFplus 1.16.1 3.5.2 msgps 1.3.1 3.5.2 msm 1.6.6 3.5.1 msmsEDA 1.20.1 3.5.2 msmsTests 1.20.1 3.5.2 MSnbase 2.8.3 3.5.2 MSnID 1.16.1 3.5.2 msPurity 1.8.1 3.5.2 msPurityData 1.10.0 3.5.2 msqc1 1.10.0 3.5.2 MSstats 3.14.1 3.5.2 MSstatsBioData 1.4.0 3.5.2 MSstatsQC 2.0.1 3.5.2 MSstatsQCgui 1.2.1 3.5.2 MSstatsTMT 1.0.1 3.5.2 mtbls2 1.12.0 3.5.2 MUGAExampleData 1.2.0 3.5.2 Mulcom 1.32.0 3.5.2 multcomp 1.4-8 3.5.1 MultiAssayExperiment 1.8.1 3.5.2 multiClust 1.12.0 3.5.2 multicool 0.1-10 3.5.1 MultiDataSet 1.10.0 3.5.2 multiHiCcompare 1.0.0 3.5.2 MultiMed 2.4.0 3.5.2 multiMiR 1.4.0 3.5.2 multiOmicsViz 1.6.0 3.5.2 multiscan 1.42.0 3.5.2 multtest 2.38.0 3.5.2 munsell 0.5.0 3.5.1 Mus.musculus 1.3.1 3.5.2 muscle 3.24.0 3.5.2 muStat 1.7.0 3.5.0 MutationalPatterns 1.8.0 3.5.2 MVCClass 1.56.0 3.5.2 mvoutData 1.18.0 3.5.2 mvoutlier 2.0.9 3.5.1 mvtnorm 1.0-8 3.5.0 MWASTools 1.6.0 3.5.2 mygene 1.18.0 3.5.2 myvariant 1.12.0 3.5.2 mzID 1.20.1 3.5.2 mzR 2.16.1 3.5.2 nabor 0.5.0 3.5.1 NADA 1.6-1 3.5.1 NADfinder 1.6.0 3.5.2 NanoStringDiff 1.12.0 3.5.2 NanoStringQCPro 1.14.0 3.5.2 NarrowPeaks 1.26.0 3.5.2 NbClust 3.0 3.5.0 nbconvertR 1.0.2 3.5.0 NBPSeq 0.3.0 3.5.0 NBSplice 1.0.1 3.5.2 ncdf4 1.16 3.5.0 ncdfFlow 2.28.1 3.5.2 ndexr 1.4.1 3.5.2 NeighborNet 1.0.0 3.5.2 nem 2.56.0 3.5.2 netbenchmark 1.14.0 3.5.2 netbiov 1.16.0 3.5.2 nethet 1.14.0 3.5.2 NetPathMiner 1.18.0 3.5.2 NetPreProc 1.1 3.5.0 netprioR 1.8.1 3.5.2 netReg 1.6.0 3.5.2 netresponse 1.42.0 3.5.2 NetSAM 1.22.0 3.5.2 netSmooth 1.2.0 3.5.2 network 1.13.0.1 3.5.1 networkBMA 2.22.0 3.5.2 networkD3 0.4 3.5.1 NGScopy 1.16.1 3.5.2 NGScopyData 1.2.0 3.5.2 nipals 0.5 3.5.1 NISTunits 1.0.1 3.5.0 nlcv 0.3.5 3.5.1 nleqslv 3.3.2 3.5.0 nlme 3.1-137 3.5.2 nloptr 1.2.1 3.5.1 NLP 0.2-0 3.5.1 nls2 0.2 3.5.1 NMF 0.21.0 3.5.1 NMFN 2.0 3.5.0 NMI 2.0 3.5.0 nnet 7.3-12 3.5.2 nnlasso 0.3 3.5.0 nnls 1.4 3.5.0 nnNorm 2.46.0 3.5.2 NOISeq 2.26.1 3.5.2 nondetects 2.12.0 3.5.2 nor1mix 1.2-3 3.5.1 norm 1.0-9.5 3.5.0 normalize450K 1.10.0 3.5.2 NormalyzerDE 1.0.0 3.5.2 NormqPCR 1.28.0 3.5.2 normr 1.8.0 3.5.2 nortest 1.0-4 3.5.0 Nozzle.R1 1.1-1 3.5.0 npGSEA 1.18.0 3.5.2 npsurv 0.4-0 3.5.0 NTW 1.32.0 3.5.2 nucleoSim 1.10.0 3.5.2 nucleR 2.14.0 3.5.2 nuCpos 1.0.1 3.5.2 nudge 1.48.0 3.5.2 numDeriv 2016.8-1 3.5.0 NuPoP 1.32.0 3.5.2 objectProperties 0.6.5 3.5.0 objectSignals 0.10.2 3.5.0 occugene 1.42.0 3.5.2 OCplus 1.56.0 3.5.2 odseq 1.10.0 3.5.2 OGSA 1.12.0 3.5.2 oligo 1.46.0 3.5.2 oligoClasses 1.44.0 3.5.2 oligoData 1.8.0 3.5.2 OLIN 1.60.0 3.5.2 OLINgui 1.56.0 3.5.2 OmaDB 1.2.2 3.5.2 omicade4 1.22.0 3.5.2 OmicCircos 1.20.0 3.5.2 omicplotR 1.2.1 3.5.2 omicRexposome 1.4.1 3.5.2 OmicsMarkeR 1.14.0 3.5.2 OMICsPCA 1.0.1 3.5.2 OMICsPCAdata 1.0.0 3.5.2 omicsPrint 1.2.1 3.5.2 Onassis 1.4.5 3.5.2 OnassisJavaLibs 1.4.2 3.5.2 oncomix 1.4.0 3.5.2 OncoScore 1.10.0 3.5.2 OncoSimulR 2.12.0 3.5.2 Oncotree 0.3.3 3.5.1 oneSENSE 1.4.1 3.5.2 onlineFDR 1.0.0 3.5.2 ontologyIndex 2.5 3.5.2 ontologyPlot 1.4 3.5.1 ontoProc 1.4.0 3.5.2 opencpu 2.1 3.5.1 openCyto 1.20.2 3.5.2 OpenImageR 1.1.4 3.5.2 openPrimeR 1.4.1 3.5.2 openPrimeRui 1.4.1 3.5.2 openssl 1.2.1 3.5.2 openxlsx 4.1.0 3.5.1 operator.tools 1.6.3 3.5.1 oposSOM 2.0.0 3.5.2 oppar 1.10.0 3.5.2 optimx 2018-7.10 3.5.1 optparse 1.6.1 3.5.2 OPWeight 1.4.1 3.5.2 ORCME 2.0.2 3.5.0 OrderedList 1.54.0 3.5.2 ordinal 2018.8-25 3.5.1 ore 1.6.2 3.5.1 ORFik 1.2.1 3.5.2 org.Ag.eg.db 3.7.0 3.5.2 org.At.tair.db 3.7.0 3.5.2 org.Bt.eg.db 3.7.0 3.5.2 org.Ce.eg.db 3.7.0 3.5.2 org.Cf.eg.db 3.7.0 3.5.2 org.Dm.eg.db 3.7.0 3.5.2 org.Dr.eg.db 3.7.0 3.5.2 org.EcK12.eg.db 3.7.0 3.5.2 org.Gg.eg.db 3.7.0 3.5.2 org.Hs.eg.db 3.7.0 3.5.2 org.Mm.eg.db 3.7.0 3.5.2 org.Pt.eg.db 3.7.0 3.5.2 org.Rn.eg.db 3.7.0 3.5.2 org.Sc.sgd.db 3.7.0 3.5.2 org.Ss.eg.db 3.7.0 3.5.2 org.Xl.eg.db 3.7.0 3.5.2 Organism.dplyr 1.10.0 3.5.2 OrganismDbi 1.24.0 3.5.2 OrgMassSpecR 0.5-3 3.5.1 ORIClust 1.0-1 3.5.0 origami 1.0.0 3.5.1 orQA 0.2.1 3.5.1 OSAT 1.30.0 3.5.2 Oscope 1.12.1 3.5.2 OTUbase 1.32.0 3.5.2 OutlierD 1.46.0 3.5.2 outliers 0.14 3.5.0 OUTRIDER 1.0.2 3.5.2 PAA 1.16.0 3.5.2 packrat 0.5.0 3.5.1 PADOG 1.24.0 3.5.2 paintmap 1.0 3.5.0 paircompviz 1.20.0 3.5.2 pairsD3 0.1.0 3.5.1 pamr 1.55 3.5.1 pan 1.6 3.5.1 pandaR 1.14.0 3.5.2 pander 0.6.3 3.5.1 panelcn.mops 1.4.0 3.5.2 panp 1.52.0 3.5.2 PANR 1.28.1 3.5.2 PANTHER.db 1.0.4 3.5.2 PanVizGenerator 1.10.0 3.5.2 PAPi 1.22.1 3.5.2 parallel 3.5.2 3.5.2 parallelMap 1.3 3.5.1 ParamHelpers 1.12 3.5.2 parathyroidSE 1.20.0 3.5.2 parcor 0.2-6 3.5.1 parglms 1.14.0 3.5.2 parmigene 1.0.2 3.5.0 parody 1.40.0 3.5.2 party 1.3-1 3.5.1 partykit 1.2-2 3.5.1 pasilla 1.10.0 3.5.2 pasillaBamSubset 0.20.0 3.5.2 PasillaTranscriptExpr 1.10.0 3.5.2 Path2PPI 1.12.0 3.5.2 pathifier 1.20.0 3.5.2 PathNet 1.22.0 3.5.2 PathNetData 1.18.0 3.5.2 pathological 0.1-2 3.5.2 PathoStat 1.8.4 3.5.2 pathprint 1.12.0 3.5.2 pathprintGEOData 1.12.0 3.5.2 pathRender 1.50.0 3.5.2 pathVar 1.12.0 3.5.2 pathview 1.22.1 3.5.2 PathwaySplice 1.6.1 3.5.2 paxtoolsr 1.16.0 3.5.2 pbapply 1.3-4 3.5.0 Pbase 0.22.1 3.5.2 pbcmc 1.10.1 3.5.2 pbivnorm 0.6.0 3.5.0 pbkrtest 0.4-7 3.5.1 pcaExplorer 2.8.1 3.5.2 pcaGoPromoter 1.26.0 3.5.2 pcaGoPromoter.Hs.hg19 1.18.0 3.5.2 pcaGoPromoter.Mm.mm9 1.18.0 3.5.2 pcaGoPromoter.Rn.rn4 1.18.0 3.5.2 pcalg 2.6-0 3.5.1 pcaMethods 1.74.0 3.5.2 PCAN 1.10.0 3.5.2 pcaPP 1.9-73 3.5.0 PCHiCdata 1.10.0 3.5.2 PCIT 1.5-3 3.5.1 pcot2 1.50.0 3.5.2 PCpheno 1.44.0 3.5.2 pcxn 2.4.0 3.5.2 pcxnData 2.4.0 3.5.2 pd.atdschip.tiling 0.20.0 3.5.2 pd.charm.hg18.example 0.99.4 3.5.2 pd.genomewidesnp.5 3.14.1 3.5.2 pd.genomewidesnp.6 3.14.1 3.5.2 pd.hg.u133a.2 3.12.0 3.5.2 pd.hg.u95a 3.12.0 3.5.2 pd.hg.u95av2 3.12.0 3.5.2 pd.hg18.60mer.expr 3.12.0 3.5.2 pd.huex.1.0.st.v2 3.14.1 3.5.2 pd.hugene.1.0.st.v1 3.14.1 3.5.2 pd.mapping250k.nsp 3.12.0 3.5.2 pd.mapping250k.sty 3.12.0 3.5.2 pd.mapping50k.hind240 3.12.0 3.5.2 pd.mapping50k.xba240 3.12.0 3.5.2 pdftools 2.1 3.5.2 pdInfoBuilder 1.46.0 3.5.2 pdist 1.2 3.5.0 PECA 1.18.0 3.5.2 penalized 0.9-51 3.5.1 pepDat 1.2.0 3.5.2 PepsNMR 1.0.1 3.5.2 PepsNMRData 1.0.0 3.5.2 pepStat 1.16.0 3.5.2 pepXMLTab 1.16.1 3.5.2 PerfMeas 1.2.1 3.5.0 PerformanceAnalytics 1.5.2 3.5.1 permute 0.9-4 3.5.1 perturbatr 1.2.1 3.5.2 PFAM.db 3.7.0 3.5.2 PGA 1.12.1 3.5.2 pgca 1.6.1 3.5.2 PGSEA 1.56.0 3.5.2 phangorn 2.4.0 3.5.1 phantasus 1.2.1 3.5.2 PharmacoGx 1.12.0 3.5.2 phastCons100way.UCSC.hg19 3.7.2 3.5.2 phastCons100way.UCSC.hg38 3.7.1 3.5.2 pheatmap 1.0.12 3.5.2 phenopath 1.6.1 3.5.2 phenoTest 1.30.0 3.5.2 PhenStat 2.18.0 3.5.2 philr 1.8.1 3.5.2 phosphonormalizer 1.6.0 3.5.2 phylobase 0.8.4 3.5.1 phyloseq 1.26.1 3.5.2 Pi 1.10.0 3.5.2 piano 1.22.0 3.5.2 picante 1.7 3.5.1 pickgene 1.54.0 3.5.2 PICS 2.26.0 3.5.2 Pigengene 1.8.1 3.5.2 pillar 1.3.1 3.5.1 pinfsc50 1.1.0 3.5.0 PING 2.26.0 3.5.2 pingr 1.1.2 3.5.1 pint 1.32.0 3.5.2 pixmap 0.4-11 3.5.0 pkgbuild 1.0.2 3.5.1 pkgconfig 2.0.2 3.5.2 pkgDepTools 1.48.0 3.5.2 pkgdown 1.3.0 3.5.1 pkgload 1.0.2 3.5.1 pkgmaker 0.27 3.5.1 plasFIA 1.10.0 3.5.2 plasmodiumanophelescdf 2.18.0 3.5.2 plateCore 1.40.1 3.5.2 plethy 1.20.0 3.5.2 plgem 1.54.1 3.5.2 plier 1.52.0 3.5.2 plogr 0.2.0 3.5.2 plot3D 1.1.1 3.5.1 plotGrouper 1.0.1 3.5.2 plotly 4.8.0 3.5.1 plotmo 3.5.2 3.5.2 plotrix 3.7-4 3.5.1 PLPE 1.42.0 3.5.2 plrs 1.22.0 3.5.2 pls 2.7-0 3.5.1 plsgenomics 1.5-2 3.5.1 plspm 0.4.9 3.5.1 plsVarSel 0.9.4 3.5.1 plw 1.42.0 3.5.2 plyr 1.8.4 3.5.1 plyranges 1.2.0 3.5.2 PMA 1.1 3.5.2 PMCMR 4.3 3.5.1 pmm 1.14.0 3.5.2 png 0.1-7 3.5.0 podkat 1.14.0 3.5.2 pogos 1.2.1 3.5.2 poibin 1.3 3.5.0 PoiClaClu 1.0.2.1 3.5.2 poilog 0.4 3.5.0 polspline 1.1.13 3.5.0 polyclip 1.9-1 3.5.1 polyester 1.18.0 3.5.2 Polyfit 1.16.1 3.5.2 polylabelr 0.1.0 3.5.1 polynom 1.3-9 3.5.0 PolynomF 1.0-2 3.5.0 PolyPhen.Hsapiens.dbSNP131 1.0.2 3.5.2 POST 1.6.0 3.5.2 PowerExplorer 1.2.2 3.5.2 poweRlaw 0.70.2 3.5.2 powerTCR 1.2.0 3.5.2 ppcor 1.1 3.5.1 ppiData 0.20.0 3.5.2 PPInfer 1.8.1 3.5.2 ppiStats 1.48.0 3.5.2 ppls 1.6-1.1 3.5.1 pqsfinder 1.10.0 3.5.2 prabclus 2.2-7 3.5.2 pracma 2.2.2 3.5.1 prada 1.58.1 3.5.2 praise 1.0.0 3.5.1 prebs 1.22.1 3.5.2 prebsdata 1.18.0 3.5.2 precrec 0.9.1 3.5.1 PREDA 1.28.0 3.5.2 PREDAsampledata 0.22.0 3.5.2 preprocessCore 1.44.0 3.5.2 preseqR 4.0.0 3.5.0 prettydoc 0.2.1 3.5.1 prettyGraphs 2.1.6 3.5.1 prettyunits 1.0.2 3.5.2 primirTSS 1.0.1 3.5.2 princurve 2.1.3 3.5.1 printr 0.1 3.5.1 Prize 1.12.1 3.5.2 proBAMr 1.16.1 3.5.2 pROC 1.13.0 3.5.1 PROcess 1.58.1 3.5.2 processx 3.2.1 3.5.1 procoil 2.10.0 3.5.2 ProCoNA 1.20.0 3.5.2 prodlim 2018.04.18 3.5.1 proFIA 1.8.1 3.5.2 profileModel 0.5-9 3.5.1 profileScoreDist 1.10.0 3.5.2 profmem 0.5.0 3.5.1 progeny 1.4.1 3.5.2 progress 1.2.0 3.5.2 pRoloc 1.22.1 3.5.2 pRolocdata 1.20.0 3.5.2 pRolocGUI 1.16.0 3.5.2 PROMISE 1.34.0 3.5.2 promises 1.0.1 3.5.1 PROPER 1.14.1 3.5.2 PROPS 1.4.0 3.5.2 Prostar 1.14.8 3.5.2 prot2D 1.20.0 3.5.2 proteinProfiles 1.22.0 3.5.2 proteomics 1.4.1 3.5.2 ProteomicsAnnotationHubData 1.12.0 3.5.2 ProteoMM 1.0.1 3.5.2 proteoQC 1.18.1 3.5.2 ProtGenerics 1.14.0 3.5.2 protiq 1.2 3.5.1 proto 1.0.0 3.5.1 protolite 1.8 3.5.1 protViz 0.4.0 3.5.2 proxy 0.4-22 3.5.1 prozor 0.2.11 3.5.1 PRROC 1.3.1 3.5.1 pryr 0.1.4 3.5.1 ps 1.3.0 3.5.2 PSCBS 0.64.0 3.5.1 pscl 1.5.2 3.5.1 PSEA 1.16.0 3.5.2 psichomics 1.8.1 3.5.2 PSICQUIC 1.20.0 3.5.2 pspline 1.0-18 3.5.0 psych 1.8.12 3.5.2 psygenet2r 1.14.0 3.5.2 PtH2O2lipids 1.8.0 3.5.2 ptw 1.9-13 3.5.1 puma 3.24.0 3.5.2 pumadata 2.18.0 3.5.2 PureCN 1.12.2 3.5.2 purrr 0.3.0 3.5.2 pvac 1.30.0 3.5.2 pvca 1.22.0 3.5.2 pvclust 2.0-0 3.5.1 Pviz 1.16.0 3.5.2 PWMEnrich 4.18.0 3.5.2 PWMEnrich.Dmelanogaster.background 4.16.0 3.5.2 PWMEnrich.Hsapiens.background 4.16.0 3.5.2 PWMEnrich.Mmusculus.background 4.16.0 3.5.2 pwOmics 1.14.0 3.5.2 qap 0.1-1 3.5.1 qcmetrics 1.20.1 3.5.2 QDNAseq 1.18.0 3.5.2 qgraph 1.6 3.5.2 qlcMatrix 0.9.7 3.5.1 qpcR 1.4-1 3.5.1 qpcrNorm 1.40.0 3.5.2 qpgraph 2.16.0 3.5.2 qPLEXanalyzer 1.0.3 3.5.2 qPLEXdata 1.0.1 3.5.2 qqman 0.1.4 3.5.1 qrqc 1.36.0 3.5.2 qsea 1.8.0 3.5.2 QSutils 1.0.0 3.5.2 qtl 1.44-9 3.5.2 QTLRel 1.0 3.5.1 quadprog 1.5-5 3.5.0 QUALIFIER 1.26.1 3.5.2 quantmod 0.4-13 3.5.1 quantreg 5.38 3.5.1 quantro 1.16.0 3.5.2 quantsmooth 1.48.0 3.5.2 QuartPAC 1.14.0 3.5.2 QuasR 1.22.1 3.5.2 QuaternaryProd 1.16.0 3.5.2 QUBIC 1.10.0 3.5.2 QUBICdata 1.10.0 3.5.2 questionr 0.7.0 3.5.1 qusage 2.16.1 3.5.2 qvalue 2.14.1 3.5.2 R.cache 0.13.0 3.5.1 R.devices 2.16.0 3.5.1 R.filesets 2.12.1 3.5.1 R.huge 0.9.0 3.5.1 R.matlab 3.6.2 3.5.1 R.methodsS3 1.7.1 3.5.0 R.oo 1.22.0 3.5.0 R.rsp 0.43.0 3.5.1 R.utils 2.7.0 3.5.1 r2glmm 0.1.2 3.5.1 R2HTML 2.3.2 3.5.1 R3CPET 1.14.0 3.5.2 r3Cseq 1.28.0 3.5.2 R453Plus1Toolbox 1.32.0 3.5.2 R4RNA 1.10.0 3.5.2 R6 2.3.0 3.5.2 radiant.data 0.9.7 3.5.1 rae230a.db 3.2.3 3.5.2 rae230aprobe 2.18.0 3.5.2 rafalib 1.0.0 3.5.0 RaggedExperiment 1.6.0 3.5.2 rain 1.16.0 3.5.2 rama 1.56.0 3.5.2 ramwas 1.6.0 3.5.2 randomcoloR 1.1.0 3.5.1 randomForest 4.6-14 3.5.1 RandomWalkRestartMH 1.2.0 3.5.2 randPack 1.28.0 3.5.2 randtests 1.0 3.5.0 ranger 0.11.1 3.5.2 RankProd 3.8.0 3.5.2 RANKS 1.0 3.5.0 RANN 2.6.1 3.5.2 rapidjsonr 1.1 3.5.1 rappdirs 0.3.1 3.5.1 rapportools 1.0 3.5.1 RareVariantVis 2.10.0 3.5.2 Rariant 1.18.0 3.5.2 rARPACK 0.11-0 3.5.1 raster 2.8-4 3.5.1 rat2302.db 3.2.3 3.5.2 Rattus.norvegicus 1.3.1 3.5.2 rbamtools 2.16.11.2 3.5.2 RbcBook1 1.50.0 3.5.2 rbenchmark 1.0.0 3.5.0 RBGL 1.58.1 3.5.2 RBioinf 1.42.0 3.5.2 rBiopaxParser 2.22.0 3.5.2 RBM 1.14.0 3.5.2 rbokeh 0.5.0 3.5.1 Rbowtie 1.22.0 3.5.2 Rbowtie2 1.4.0 3.5.2 rbsurv 2.40.0 3.5.2 Rcade 1.24.0 3.5.2 RCAS 1.8.0 3.5.2 RCASPAR 1.28.0 3.5.2 rcdk 3.4.7.1 3.5.1 rcdklibs 2.0 3.5.0 rcellminer 2.4.0 3.5.2 rcellminerData 2.4.0 3.5.2 rCGH 1.12.0 3.5.2 Rchemcpp 2.20.1 3.5.2 rChoiceDialogs 1.0.6 3.5.0 RchyOptimyx 2.22.0 3.5.2 RCircos 1.2.0 3.5.0 RcisTarget 1.2.0 3.5.2 RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp 1.2.0 3.5.2 rclipboard 0.1 3.5.1 rcmdcheck 1.3.2 3.5.2 RcmdrMisc 2.5-1 3.5.1 RColorBrewer 1.1-2 3.5.0 Rcpi 1.18.1 3.5.2 Rcpp 1.0.0 3.5.2 RcppAnnoy 0.0.11 3.5.1 RcppArmadillo 0.9.200.7.0 3.5.2 RcppClassic 0.9.11 3.5.1 RcppEigen 0.3.3.5.0 3.5.1 RcppGSL 0.3.6 3.5.1 RcppNumerical 0.3-2 3.5.1 RcppParallel 4.4.2 3.5.1 RcppProgress 0.4.1 3.5.1 RcppRoll 0.3.0 3.5.1 RcppZiggurat 0.1.5 3.5.1 Rcsdp 0.1.55 3.5.0 RCurl 1.95-4.11 3.5.1 RCy3 2.2.6 3.5.2 RCyjs 2.4.0 3.5.2 rda 1.0.2-2.1 3.5.1 RDAVIDWebService 1.20.0 3.5.2 rDGIdb 1.8.0 3.5.2 Rdisop 1.42.1 3.5.2 Rdpack 0.10-1 3.5.1 rdrop2 0.8.1 3.5.1 RDRToolbox 1.32.0 3.5.2 reactome.db 1.66.0 3.5.2 ReactomePA 1.26.0 3.5.2 readat 1.8.0 3.5.2 readbitmap 0.1.5 3.5.1 ReadqPCR 1.28.0 3.5.2 readr 1.3.1 3.5.2 readstata13 0.9.2 3.5.1 readxl 1.2.0 3.5.2 reb 1.60.0 3.5.2 REBET 1.0.0 3.5.2 rebus 0.1-3 3.5.1 rebus.base 0.0-3 3.5.1 rebus.datetimes 0.0-1 3.5.1 rebus.numbers 0.0-1 3.5.1 rebus.unicode 0.0-2 3.5.1 recipes 0.1.4 3.5.1 RecordLinkage 0.4-10 3.5.1 recount 1.8.1 3.5.2 recountWorkflow 1.4.1 3.5.2 recoup 1.10.1 3.5.2 RedeR 1.30.0 3.5.2 REDseq 1.28.0 3.5.2 RefFreeEWAS 2.2 3.5.1 refGenome 1.7.3.1 3.5.2 RefManageR 1.2.0 3.5.1 RefNet 1.18.0 3.5.2 RefPlus 1.52.0 3.5.2 regioneR 1.14.0 3.5.2 regionReport 1.16.1 3.5.2 registry 0.5 3.5.0 regress 1.3-15 3.5.1 regsplice 1.8.1 3.5.2 relations 0.6-8 3.5.1 relimp 1.0-5 3.5.1 rematch 1.0.1 3.5.1 rematch2 2.0.1 3.5.1 remotes 2.0.2 3.5.1 REMP 1.6.1 3.5.2 rentrez 1.2.1 3.5.1 ReorderCluster 1.0 3.5.1 Repitools 1.28.0 3.5.2 repo 2.1.3 3.5.1 ReportingTools 2.22.1 3.5.2 reportr 1.3.0 3.5.1 reprex 0.2.1 3.5.1 ReQON 1.28.0 3.5.2 reshape 0.8.8 3.5.1 reshape2 1.4.3 3.5.1 restfulSE 1.4.1 3.5.2 restfulSEData 1.4.0 3.5.2 reticulate 1.10 3.5.1 reutils 0.2.3 3.5.1 rex 1.1.2 3.5.1 rexposome 1.4.0 3.5.2 Rfast 1.9.2 3.5.1 RFOC 3.4-6 3.5.1 RforProteomics 1.20.0 3.5.2 rfPermute 2.1.6 3.5.1 rfPred 1.20.0 3.5.2 rGADEM 2.30.0 3.5.2 RGalaxy 1.26.0 3.5.2 rgeos 0.4-2 3.5.1 rgexf 0.15.3 3.5.1 rggobi 2.1.22 3.5.1 Rgin 1.2.0 3.5.2 rgl 0.99.16 3.5.1 RGMQL 1.2.0 3.5.2 RGMQLlib 1.2.0 3.5.2 RGraph2js 1.10.0 3.5.2 Rgraphviz 2.26.0 3.5.2 rGREAT 1.14.0 3.5.2 RGSEA 1.16.0 3.5.2 rgsepd 1.14.1 3.5.2 RGtk2 2.20.35 3.5.0 rhandsontable 0.3.7 3.5.1 rhdf5 2.26.2 3.5.2 rhdf5client 1.4.1 3.5.2 Rhdf5lib 1.4.2 3.5.2 RhpcBLASctl 0.18-205 3.5.1 Rhtslib 1.14.0 3.5.2 rHVDM 1.48.0 3.5.2 RiboProfiling 1.12.0 3.5.2 riboSeqR 1.16.0 3.5.2 RImmPort 1.10.0 3.5.2 Ringo 1.46.0 3.5.2 rintrojs 0.2.0 3.5.1 rio 0.5.16 3.5.1 rioja 0.9-15.1 3.5.1 RIPSeeker 1.22.0 3.5.2 Risa 1.24.0 3.5.2 RISmed 2.1.7 3.5.0 RITAN 1.6.0 3.5.2 RITANdata 1.6.0 3.5.2 RIVER 1.6.0 3.5.2 rjags 4-8 3.5.1 rJava 0.9-10 3.5.0 RJMCMCNucleosomes 1.6.0 3.5.2 rjson 0.2.20 3.5.0 RJSONIO 1.3-1.1 3.5.1 Rlab 2.15.1 3.5.0 Rlabkey 2.2.4 3.5.1 rlang 0.3.1 3.5.2 rlecuyer 0.3-4 3.5.0 rlist 0.4.6.1 3.5.1 RLMM 1.44.0 3.5.2 Rmagpie 1.38.0 3.5.2 RMallow 1.0 3.5.0 RMariaDB 1.0.6 3.5.1 rmarkdown 1.11 3.5.1 RMassBank 2.10.1 3.5.2 RMassBankData 1.20.0 3.5.2 rmeta 3.0 3.5.0 RmiR 1.38.0 3.5.2 RmiR.Hs.miRNA 1.0.7 3.5.2 Rmixmod 2.1.2 3.5.1 Rmmquant 1.0.2 3.5.2 Rmpfr 0.7-2 3.5.2 Rmpi 0.6-9 3.5.1 rms 5.1-3 3.5.2 RMTstat 0.3 3.5.0 rmutil 1.1.1 3.5.0 RMySQL 0.10.16 3.5.2 RNAdecay 1.2.1 3.5.2 RNAinteract 1.30.1 3.5.2 RNAither 2.30.1 3.5.2 RNAprobR 1.14.0 3.5.2 RNAseq123 1.4.3 3.5.2 rnaseqcomp 1.12.0 3.5.2 RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14 0.20.0 3.5.2 rnaseqDTU 1.0.1 3.5.2 rnaseqGene 1.4.1 3.5.2 RnaSeqGeneEdgeRQL 1.4.1 3.5.2 rnaSeqMap 2.40.1 3.5.2 RNASeqPower 1.22.1 3.5.2 RnaSeqSampleSize 1.14.1 3.5.2 RnaSeqSampleSizeData 1.14.0 3.5.2 RnBeads 2.0.1 3.5.2 RnBeads.hg19 1.14.0 3.5.2 rncl 0.8.3 3.5.1 RNeXML 2.3.0 3.5.2 rngtools 1.3.1 3.5.1 RNifti 0.10.0 3.5.1 Rnits 1.16.0 3.5.2 roar 1.18.0 3.5.2 robCompositions 2.0.9 3.5.1 robust 0.4-18 3.5.1 robustbase 0.93-3 3.5.1 RobustRankAggreg 1.1 3.5.0 ROC 1.58.0 3.5.2 ROCR 1.0-7 3.5.1 Roleswitch 1.20.0 3.5.2 rols 2.10.1 3.5.2 ROntoTools 2.10.0 3.5.2 Rook 1.1-1 3.5.0 rootSolve 1.7 3.5.0 ropls 1.14.1 3.5.2 ROTS 1.10.1 3.5.2 roxygen2 6.1.1 3.5.1 RPA 1.38.0 3.5.2 rpart 4.1-13 3.5.2 rpart.plot 3.0.6 3.5.1 rphast 1.6.9 3.5.1 RPMG 2.2-2 3.5.0 RPMM 1.25 3.5.1 RPostgreSQL 0.6-2 3.5.1 rprojroot 1.3-2 3.5.1 RProtoBuf 0.4.13 3.5.1 RProtoBufLib 1.4.0 3.5.2 RpsiXML 2.24.0 3.5.2 rpx 1.18.1 3.5.2 Rqc 1.16.2 3.5.2 rqt 1.8.0 3.5.2 rqubic 1.28.0 3.5.2 rrcov 1.4-7 3.5.1 rRDP 1.16.1 3.5.2 rRDPData 1.2.0 3.5.2 RRHO 1.22.0 3.5.2 Rsamtools 1.34.0 3.5.2 rsbml 2.40.0 3.5.2 rsconnect 0.8.13 3.5.2 RSEIS 3.8-3 3.5.1 RSeqAn 1.2.0 3.5.2 Rserve 1.7-3 3.5.0 rsm 2.10 3.5.1 RSNNS 0.4-11 3.5.1 rsnps 0.3.0 3.5.1 Rsolnp 1.16 3.5.1 RSpectra 0.13-1 3.5.1 RSQLite 2.1.1 3.5.2 rstan 2.18.2 3.5.1 rstantools 1.5.1 3.5.1 rstudioapi 0.9.0 3.5.2 rsvd 1.0.0 3.5.1 rsvg 1.3 3.5.1 RSVGTipsDevice 1.0-7 3.5.2 RSVSim 1.22.0 3.5.2 rTANDEM 1.22.1 3.5.2 RTCA 1.34.1 3.5.2 RTCGA 1.12.1 3.5.2 RTCGA.clinical 20151101.12.0 3.5.2 RTCGA.CNV 1.10.0 3.5.2 RTCGA.methylation 1.10.0 3.5.2 RTCGA.miRNASeq 1.10.0 3.5.2 RTCGA.mRNA 1.10.0 3.5.2 RTCGA.mutations 20151101.12.0 3.5.2 RTCGA.PANCAN12 1.10.0 3.5.2 RTCGA.rnaseq 20151101.12.0 3.5.2 RTCGA.RPPA 1.10.0 3.5.2 RTCGAToolbox 2.12.1 3.5.2 rtfbs 0.3.9 3.5.1 RTN 2.6.2 3.5.2 RTNduals 1.6.0 3.5.2 RTNsurvival 1.6.0 3.5.2 RTopper 1.28.0 3.5.2 rtracklayer 1.42.1 3.5.2 Rtreemix 1.44.0 3.5.2 rTRM 1.20.0 3.5.2 rTRMui 1.20.0 3.5.2 Rtsne 0.15 3.5.1 Rttf2pt1 1.3.7 3.5.0 runibic 1.4.0 3.5.2 RUnit 0.4.32 3.5.2 ruv 0.9.7 3.5.1 RUVcorr 1.14.0 3.5.2 RUVnormalize 1.16.0 3.5.2 RUVnormalizeData 1.2.0 3.5.2 RUVSeq 1.16.1 3.5.2 rvcheck 0.1.3 3.5.1 rvest 0.3.2 3.5.1 RVS 1.4.1 3.5.2 Rwave 2.4-8 3.5.0 RWeka 0.4-39 3.5.1 RWekajars 3.9.3-1 3.5.1 rWikiPathways 1.2.0 3.5.2 s4vd 1.1-1 3.5.1 S4Vectors 0.20.1 3.5.2 safe 3.22.0 3.5.2 sagenhaft 1.52.0 3.5.2 SAGx 1.56.0 3.5.2 sampleClassifier 1.6.1 3.5.2 sampleClassifierData 1.6.0 3.5.2 sampling 2.8 3.5.1 samr 3.0 3.5.1 SamSPECTRAL 1.36.1 3.5.2 sandwich 2.5-0 3.5.1 sangerseqR 1.18.0 3.5.2 SANTA 2.20.0 3.5.2 sapFinder 1.20.1 3.5.2 savR 1.20.0 3.5.2 SBMLR 1.78.0 3.5.2 SC3 1.10.1 3.5.2 Scale4C 1.4.0 3.5.2 scales 1.0.0 3.5.1 SCAN.UPC 2.24.1 3.5.2 scater 1.10.1 3.5.2 scatterplot3d 0.3-41 3.5.0 scDD 1.6.1 3.5.2 scde 2.10.1 3.5.2 scFeatureFilter 1.2.1 3.5.2 scfind 1.4.1 3.5.2 ScISI 1.54.0 3.5.2 SCLCBam 1.14.0 3.5.2 scmap 1.4.1 3.5.2 scmeth 1.2.2 3.5.2 SCnorm 1.4.5 3.5.2 scone 1.6.1 3.5.2 Sconify 1.2.1 3.5.2 scoreInvHap 1.4.0 3.5.2 scPipe 1.4.1 3.5.2 scran 1.10.2 3.5.2 scrime 1.3.5 3.5.1 scRNAseq 1.8.0 3.5.2 scsR 1.18.0 3.5.2 sda 1.3.7 3.5.1 SDAMS 1.2.1 3.5.2 SDMTools 1.1-221 3.5.1 segmented 0.5-3.0 3.5.0 segmentSeq 2.16.0 3.5.2 selectr 0.4-1 3.5.1 SELEX 1.14.0 3.5.2 sem 3.1-9 3.5.1 SemDist 1.16.0 3.5.2 semisup 1.6.0 3.5.2 sendmailR 1.2-1 3.5.0 SEPA 1.12.0 3.5.2 SEPIRA 1.2.0 3.5.2 seq2pathway 1.14.0 3.5.2 seq2pathway.data 1.14.0 3.5.2 SeqArray 1.22.3 3.5.2 seqbias 1.30.0 3.5.2 seqCAT 1.4.1 3.5.2 seqCNA 1.28.0 3.5.2 seqCNA.annot 1.18.0 3.5.2 seqcombo 1.4.1 3.5.2 SeqGSEA 1.22.1 3.5.2 seqinr 3.4-5 3.5.1 seqLogo 1.48.0 3.5.2 seqPattern 1.14.0 3.5.2 seqplots 1.20.1 3.5.2 seqsetvis 1.2.0 3.5.2 SeqSQC 1.4.0 3.5.2 seqTools 1.16.0 3.5.2 sequencing 1.4.1 3.5.2 SeqVarTools 1.20.0 3.5.2 seriation 1.2-3 3.5.1 serumStimulation 1.18.0 3.5.2 servr 0.11 3.5.1 sesame 1.0.0 3.5.2 sesameData 1.0.0 3.5.2 sessioninfo 1.1.1 3.5.1 setRNG 2013.9-1 3.5.0 sets 1.0-18 3.5.1 settings 0.2.4 3.5.1 Seurat 2.3.4 3.5.1 sevenbridges 1.12.3 3.5.2 sevenC 1.2.0 3.5.2 sfsmisc 1.1-3 3.5.1 sgeostat 1.0-27 3.5.0 SGSeq 1.16.2 3.5.2 shades 1.3.1 3.5.2 shape 1.4.4 3.5.0 shiny 1.2.0 3.5.1 shinyAce 0.3.3 3.5.2 shinyalert 1.0 3.5.1 shinyBS 0.61 3.5.1 shinycssloaders 0.2.0 3.5.1 shinydashboard 0.7.1 3.5.1 shinyFiles 0.7.2 3.5.1 shinyjqui 0.3.2 3.5.1 shinyjs 1.0 3.5.1 shinyMethyl 1.18.0 3.5.2 shinyMethylData 1.2.0 3.5.2 shinyTANDEM 1.20.1 3.5.2 shinythemes 1.1.2 3.5.1 shinyTree 0.2.6 3.5.1 shinyWidgets 0.4.4 3.5.1 ShortRead 1.40.0 3.5.2 showtext 0.6 3.5.2 showtextdb 2.0 3.5.1 SIAMCAT 1.2.1 3.5.2 SIFT.Hsapiens.dbSNP132 1.0.2 3.5.2 SIFT.Hsapiens.dbSNP137 1.0.0 3.5.2 sigaR 1.30.0 3.5.2 SigCheck 2.14.0 3.5.2 sigclust 1.1.0 3.5.0 sigFeature 1.0.0 3.5.2 SigFuge 1.20.0 3.5.2 siggenes 1.56.0 3.5.2 sights 1.8.1 3.5.2 signal 0.7-6 3.5.1 signeR 1.8.0 3.5.2 signet 1.2.2 3.5.2 sigPathway 1.50.0 3.5.2 sigsquared 1.14.0 3.5.2 SIM 1.52.0 3.5.2 SIMAT 1.14.1 3.5.2 SimBindProfiles 1.20.0 3.5.2 SIMD 1.0.0 3.5.2 similaRpeak 1.14.0 3.5.2 SIMLR 1.8.1 3.5.2 simpIntLists 1.18.0 3.5.2 simpleaffy 2.58.0 3.5.2 simpleSingleCell 1.4.1 3.5.2 simulatorZ 1.16.0 3.5.2 sincell 1.14.1 3.5.2 SingleCellExperiment 1.4.1 3.5.2 singleCellTK 1.2.3 3.5.2 singscore 1.2.2 3.5.2 SISPA 1.12.0 3.5.2 sizepower 1.52.0 3.5.2 skewr 1.14.0 3.5.2 slalom 1.4.1 3.5.2 slam 0.1-44 3.5.2 SLGI 1.42.0 3.5.2 slingshot 1.0.0 3.5.2 slinky 1.0.0 3.5.2 SLqPCR 1.48.0 3.5.2 sm 2.2-5.6 3.5.1 SMAP 1.46.0 3.5.2 SmartSVA 0.1.3 3.5.1 smatr 3.4-8 3.5.0 sme 1.0.2 3.5.1 SMITE 1.10.1 3.5.2 smoother 1.1 3.5.1 smoothie 1.0-1 3.5.1 smoothmest 0.1-2 3.5.1 SmoothWin 2.0.0 3.5.1 SMVar 1.3.3 3.5.0 sna 2.4 3.5.1 SNAGEE 1.22.0 3.5.2 SNAGEEdata 1.18.0 3.5.2 snapCGH 1.52.0 3.5.2 SNFtool 2.3.0 3.5.1 snm 1.30.0 3.5.2 snow 0.4-3 3.5.2 SnowballC 0.6.0 3.5.2 snowfall 1.84-6.1 3.5.1 SNPchip 2.28.0 3.5.2 SNPediaR 1.8.0 3.5.2 SNPhood 1.12.0 3.5.2 SNPhoodData 1.12.0 3.5.2 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109 0.99.7 3.5.2 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608 0.99.11 3.5.2 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38 0.99.11 3.5.2 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP142.GRCh37 0.99.5 3.5.2 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37 0.99.20 3.5.2 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38 0.99.20 3.5.2 SNPRelate 1.16.0 3.5.2 snpStats 1.32.0 3.5.2 softImpute 1.4 3.5.1 soGGi 1.14.0 3.5.2 som 0.3-5.1 3.5.0 SomaticCancerAlterations 1.18.0 3.5.2 SomaticSignatures 2.18.0 3.5.2 sourcetools 0.1.7 3.5.1 sp 1.3-1 3.5.1 SpacePAC 1.20.0 3.5.2 spam 2.2-1 3.5.2 SPARQL 1.16 3.5.1 sparsebn 0.0.5 3.5.1 sparsebnUtils 0.0.6 3.5.1 SparseDC 0.1.17 3.5.1 sparseDOSSA 1.6.1 3.5.2 sparseinv 0.1.3 3.5.1 SparseM 1.77 3.5.0 sparseMVN 0.2.1.1 3.5.1 sparsenetgls 1.0.1 3.5.2 SparseSignatures 1.2.0 3.5.2 sparsesvd 0.1-4 3.5.1 spatial 7.3-11 3.5.2 SpatialExtremes 2.0-7 3.5.1 SpatialTools 1.0.4 3.5.1 spatstat 1.58-2 3.5.2 spatstat.data 1.4-0 3.5.1 spatstat.utils 1.13-0 3.5.1 spBayes 0.4-1 3.5.1 spData 0.3.0 3.5.2 spdep 0.8-1 3.5.1 speaq 2.4.0 3.5.1 specL 1.16.1 3.5.2 SpeCond 1.36.0 3.5.2 speedglm 0.3-2 3.5.1 spelling 2.0 3.5.1 SPEM 1.22.0 3.5.2 SPIA 2.34.0 3.5.2 SpidermiR 1.12.1 3.5.2 SpikeIn 1.24.0 3.5.2 SpikeInSubset 1.22.0 3.5.2 spikeLI 2.42.0 3.5.2 spkTools 1.38.0 3.5.2 splancs 2.01-40 3.5.1 splatter 1.6.1 3.5.2 splicegear 1.54.0 3.5.2 spliceSites 1.30.0 3.5.2 SplicingGraphs 1.22.2 3.5.2 splines 3.5.2 3.5.2 splineTimeR 1.10.0 3.5.2 SPLINTER 1.8.1 3.5.2 splitstackshape 1.4.6 3.5.1 splots 1.48.0 3.5.2 splus2R 1.2-2 3.5.0 SPONGE 1.4.0 3.5.2 spotSegmentation 1.56.0 3.5.2 sqldf 0.4-11 3.5.1 SQN 1.0.5 3.5.1 SQUADD 1.32.0 3.5.2 SQUAREM 2017.10-1 3.5.0 squash 1.0.8 3.5.0 SRAdb 1.44.0 3.5.2 sRAP 1.22.0 3.5.2 SRGnet 1.8.0 3.5.2 srnadiff 1.2.1 3.5.2 sROC 0.1-2 3.5.0 sscore 1.54.0 3.5.2 sscu 2.12.0 3.5.2 sSeq 1.20.1 3.5.2 ssize 1.56.0 3.5.2 SSPA 2.22.1 3.5.2 ssviz 1.16.1 3.5.2 st 1.2.5 3.5.1 stable 1.1.3 3.5.1 stabledist 0.7-1 3.5.1 stabs 0.6-3 3.5.1 stageR 1.4.0 3.5.2 STAN 2.10.1 3.5.2 StanHeaders 2.18.1 3.5.2 staRank 1.24.1 3.5.2 StarBioTrek 1.8.1 3.5.2 Starr 1.38.0 3.5.2 startupmsg 0.9.5 3.5.1 STATegRa 1.18.0 3.5.2 statip 0.2.0 3.5.1 statmod 1.4.30 3.5.1 statnet.common 4.2.0 3.5.2 stats 3.5.2 3.5.2 stats4 3.5.2 3.5.2 statTarget 1.12.1 3.5.2 stemHypoxia 1.18.0 3.5.2 stepNorm 1.54.0 3.5.2 stjudem 1.22.0 3.5.2 strandCheckR 1.0.0 3.5.2 Streamer 1.28.0 3.5.2 STRINGdb 1.22.0 3.5.2 stringdist 0.9.5.1 3.5.2 stringi 1.2.4 3.5.2 stringr 1.3.1 3.5.2 STROMA4 1.6.1 3.5.2 strucchange 1.5-1 3.5.1 subSeq 1.12.1 3.5.2 SummarizedBenchmark 2.0.1 3.5.2 SummarizedExperiment 1.12.0 3.5.2 summarytools 0.8.8 3.5.1 superheat 0.1.0 3.5.1 SuperLearner 2.0-24 3.5.1 superpc 1.09 3.5.1 SuppDists 1.1-9.4 3.5.0 supraHex 1.20.0 3.5.2 survcomp 1.32.0 3.5.2 survey 3.35-1 3.5.2 survival 2.43-3 3.5.2 survivalROC 1.0.3 3.5.0 survminer 0.4.3 3.5.1 survMisc 0.5.5 3.5.1 Sushi 1.20.0 3.5.2 sva 3.30.1 3.5.2 SVAPLSseq 1.8.1 3.5.2 svd 0.4.1 3.5.1 svDialogs 1.0.0 3.5.1 svglite 1.2.1 3.5.1 svGUI 1.0.0 3.5.1 SVM2CRM 1.14.0 3.5.2 SVM2CRMdata 1.14.0 3.5.2 SWATH2stats 1.12.1 3.5.2 SwathXtend 2.4.0 3.5.2 swfdr 1.8.0 3.5.2 swfscMisc 1.2 3.5.1 SwimR 1.20.0 3.5.2 switchBox 1.18.0 3.5.2 switchde 1.8.1 3.5.2 synapter 2.6.1 3.5.2 synapterdata 1.20.0 3.5.2 synergyfinder 1.8.0 3.5.2 synlet 1.12.1 3.5.2 sys 2.1 3.5.1 sysfonts 0.8 3.5.1 systemPipeR 1.16.1 3.5.2 targetscan.Hs.eg.db 0.6.1 3.5.2 targetscan.Mm.eg.db 0.6.1 3.5.2 TargetScore 1.20.0 3.5.2 TargetScoreData 1.18.0 3.5.2 TargetSearch 1.38.1 3.5.2 TargetSearchData 1.20.0 3.5.2 TarSeqQC 1.12.0 3.5.2 TBX20BamSubset 1.18.0 3.5.2 TCC 1.22.1 3.5.2 TCGAbiolinks 2.10.2 3.5.2 TCGAbiolinksGUI 1.8.0 3.5.2 TCGAbiolinksGUI.data 1.2.0 3.5.2 TCGAMethylation450k 1.18.0 3.5.2 TCGAutils 1.2.1 3.5.2 TCGAWorkflow 1.4.1 3.5.2 TCGAWorkflowData 1.6.0 3.5.2 tcltk 3.5.2 3.5.2 tcltk2 1.2-11 3.5.0 tcR 2.2.3 3.5.2 TCseq 1.6.1 3.5.2 TDARACNE 1.32.0 3.5.2 TeachingDemos 2.10 3.5.1 tensor 1.5 3.5.0 tensorA 0.36.1 3.5.1 TENxBrainData 1.2.0 3.5.2 tenXplore 1.4.1 3.5.2 TEQC 4.4.0 3.5.2 ternarynet 1.26.0 3.5.2 test3cdf 2.18.0 3.5.2 tester 0.1.7 3.5.1 testthat 2.0.1 3.5.1 TFARM 1.4.0 3.5.2 TFBSTools 1.20.0 3.5.2 TFEA.ChIP 1.2.3 3.5.2 TFHAZ 1.4.0 3.5.2 TFMPvalue 0.0.8 3.5.1 TFutils 1.2.0 3.5.2 TH.data 1.0-10 3.5.2 threejs 0.3.1 3.5.1 tibble 2.0.1 3.5.2 tidyr 0.8.2 3.5.1 tidyselect 0.2.5 3.5.1 tidytree 0.2.1 3.5.2 tidyverse 1.2.1 3.5.1 tiff 0.1-5 3.5.0 tigre 1.36.0 3.5.2 tilingArray 1.60.0 3.5.2 timecourse 1.54.0 3.5.2 timeDate 3043.102 3.5.1 timescape 1.6.0 3.5.2 timeSeries 3042.102 3.5.1 TimeSeriesExperiment 1.0.4 3.5.2 timsac 1.3.6 3.5.0 TIN 1.14.0 3.5.2 tinytex 0.10 3.5.2 TissueEnrich 1.2.1 3.5.2 TitanCNA 1.20.1 3.5.2 tkrgl 0.8 3.5.1 tkrplot 0.0-24 3.5.1 tkWidgets 1.60.0 3.5.2 tm 0.7-6 3.5.2 TMB 1.7.15 3.5.1 TMixClust 1.4.0 3.5.2 tmle 1.3.0-1 3.5.1 tmvtnorm 1.4-10 3.5.1 TnT 1.4.0 3.5.2 tofsims 1.10.1 3.5.2 tofsimsData 1.10.0 3.5.2 tools 3.5.2 3.5.2 ToPASeq 1.16.1 3.5.2 topdownr 1.4.1 3.5.2 topdownrdata 1.4.0 3.5.2 topGO 2.34.0 3.5.2 topicmodels 0.2-8 3.5.2 topologyGSA 1.4.6 3.5.1 TPP 3.10.1 3.5.2 tracktables 1.16.0 3.5.2 trackViewer 1.18.0 3.5.2 tractor.base 3.3.0 3.5.1 transcriptogramer 1.4.1 3.5.2 transcriptR 1.10.1 3.5.2 transite 1.0.1 3.5.2 translations 3.5.2 3.5.2 tRanslatome 1.20.0 3.5.2 TransView 1.26.1 3.5.2 traseR 1.12.0 3.5.2 tree 1.0-39 3.5.1 treeio 1.6.2 3.5.2 Trendy 1.4.4 3.5.2 triebeard 0.3.0 3.5.1 triform 1.24.0 3.5.2 trigger 1.28.0 3.5.2 trimcluster 0.1-2.1 3.5.1 trio 3.20.0 3.5.2 triplex 1.22.0 3.5.2 tRNA 1.0.0 3.5.2 tRNAdbImport 1.0.0 3.5.2 tRNAscanImport 1.2.0 3.5.2 TRONCO 2.14.2 3.5.2 truncdist 1.0-2 3.5.1 truncnorm 1.0-8 3.5.1 trust 0.1-7 3.5.0 TSCAN 1.20.0 3.5.2 tseries 0.10-46 3.5.1 tsne 0.1-3 3.5.0 TSP 1.1-6 3.5.1 tspair 1.40.0 3.5.2 TSRchitect 1.8.9 3.5.2 TSSi 1.28.0 3.5.2 TTMap 1.4.0 3.5.2 TTR 0.23-4 3.5.1 TurboNorm 1.30.0 3.5.2 turner 0.1.7 3.5.1 tweeDEseq 1.28.1 3.5.2 tweeDEseqCountData 1.20.0 3.5.2 tweenr 1.0.1 3.5.1 twilight 1.58.0 3.5.2 twoddpcr 1.6.0 3.5.2 TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart22 3.0.1 3.5.2 TxDb.Celegans.UCSC.ce6.ensGene 3.2.2 3.5.2 TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm3.ensGene 3.2.2 3.5.2 TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm6.ensGene 3.4.4 3.5.2 TxDb.Drerio.UCSC.danRer10.refGene 3.4.4 3.5.2 TxDb.Ggallus.UCSC.galGal5.refGene 3.4.4 3.5.2 TxDb.Hsapiens.UCSC.hg18.knownGene 3.2.2 3.5.2 TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene 3.2.2 3.5.2 TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.lincRNAsTranscripts 3.2.2 3.5.2 TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene 3.4.0 3.5.2 TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGene 3.4.0 3.5.2 TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene 3.4.4 3.5.2 TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene 3.2.2 3.5.2 TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn4.ensGene 3.2.2 3.5.2 TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn5.refGene 3.4.4 3.5.2 TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn6.refGene 3.4.4 3.5.2 TxDb.Scerevisiae.UCSC.sacCer3.sgdGene 3.2.2 3.5.2 tximeta 1.0.3 3.5.2 tximport 1.10.1 3.5.2 tximportData 1.10.0 3.5.2 TxRegInfra 1.2.0 3.5.2 TypeInfo 1.48.0 3.5.2 ucminf 1.1-4 3.5.0 Ularcirc 1.0.0 3.5.2 umap 0.2.0.0 3.5.1 UNDO 1.24.0 3.5.2 unifiedWMWqPCR 1.18.0 3.5.2 UniProt.ws 2.22.0 3.5.2 uniqtag 1.0 3.5.1 Uniquorn 2.2.1 3.5.2 units 0.6-2 3.5.1 universalmotif 1.0.12 3.5.2 UpSetR 1.3.3 3.5.1 urltools 1.7.1 3.5.1 usethis 1.4.0 3.5.1 uSORT 1.8.1 3.5.2 utf8 1.1.4 3.5.1 utils 3.5.2 3.5.2 uuid 0.1-2 3.5.0 V8 1.5 3.5.1 VanillaICE 1.44.0 3.5.2 varhandle 2.0.3 3.5.1 variancePartition 1.12.1 3.5.2 VariantAnnotation 1.28.10 3.5.2 VariantFiltering 1.18.0 3.5.2 variants 1.4.1 3.5.2 VariantTools 1.24.0 3.5.2 varSelRF 0.7-8 3.5.1 vbmp 1.50.0 3.5.2 vcd 1.4-4 3.5.1 vcfR 1.8.0 3.5.1 vdiffr 0.3.0 3.5.2 Vega 1.30.0 3.5.2 VegaMC 3.20.0 3.5.2 vegan 2.5-3 3.5.1 venn 1.7 3.5.1 VennDiagram 1.6.20 3.5.1 verification 1.42 3.5.1 VGAM 1.0-6 3.5.1 vidger 1.2.1 3.5.2 VIM 4.7.0 3.5.1 vioplot 0.3.0 3.5.2 viper 1.16.0 3.5.2 vipor 0.4.5 3.5.1 viridis 0.5.1 3.5.1 viridisLite 0.3.0 3.5.1 visNetwork 2.0.5 3.5.1 vsn 3.50.0 3.5.2 vtpnet 0.22.0 3.5.2 vulcan 1.4.0 3.5.2 vulcandata 1.4.0 3.5.2 waffle 0.7.0 3.5.1 wateRmelon 1.26.0 3.5.2 wavClusteR 2.16.1 3.5.2 waveslim 1.7.5.1 3.5.2 wavethresh 4.6.8 3.5.1 waveTiling 1.24.0 3.5.2 waveTilingData 1.18.0 3.5.2 weaver 1.48.0 3.5.2 webbioc 1.54.0 3.5.2 webshot 0.5.1 3.5.1 webutils 0.6 3.5.1 WES.1KG.WUGSC 1.14.0 3.5.2 WGCNA 1.66 3.5.1 wheatmap 0.1.0 3.5.1 whisker 0.3-2 3.5.1 widgetTools 1.60.0 3.5.2 wiggleplotr 1.6.1 3.5.2 withr 2.1.2 3.5.1 wmtsa 2.0-3 3.5.1 wordcloud 2.6 3.5.1 Wrench 1.0.0 3.5.2 writexl 1.1 3.5.1 WriteXLS 4.0.0 3.5.0 XBSeq 1.14.1 3.5.2 xcms 3.4.2 3.5.2 XDE 2.28.0 3.5.2 xfun 0.4 3.5.2 xgboost 0.71.2 3.5.1 XGR 1.1.4 3.5.1 XINA 1.0.1 3.5.2 XLConnect 0.2-15 3.5.1 XLConnectJars 0.2-15 3.5.0 xlsx 0.6.1 3.5.0 xlsxjars 0.6.1 3.5.0 xmapbridge 1.40.0 3.5.2 Xmisc 0.2.1 3.5.1 XML 3.98-1.16 3.5.1 xml2 1.2.0 3.5.1 xopen 1.0.0 3.5.1 xtable 1.8-3 3.5.1 XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37 0.99.12 3.5.2 XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38 0.99.12 3.5.2 xts 0.11-2 3.5.1 XVector 0.22.0 3.5.2 yaml 2.2.0 3.5.2 yamss 1.8.1 3.5.2 YAPSA 1.8.0 3.5.2 yaqcaffy 1.42.0 3.5.2 yarn 1.8.0 3.5.2 yeast2.db 3.2.3 3.5.2 yeastCC 1.22.0 3.5.2 yeastExpData 0.28.0 3.5.2 yeastNagalakshmi 1.18.0 3.5.2 yeastRNASeq 0.20.0 3.5.2 yri1kgv 0.24.0 3.5.2 zCompositions 1.1.2 3.5.1 zebrafishRNASeq 1.2.0 3.5.2 zFPKM 1.4.1 3.5.2 zinbwave 1.4.1 3.5.2 zip 1.0.0 3.5.1 zlibbioc 1.28.0 3.5.2 zoo 1.8-4 3.5.1