############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data ATACCoGAPS ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘ATACCoGAPS/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘ATACCoGAPS’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes ----------------------------------- ERROR: dependencies ‘TFBSTools’, ‘motifmatchr’, ‘chromVAR’, ‘rGREAT’, ‘JASPAR2016’, ‘Homo.sapiens’, ‘Mus.musculus’, ‘BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19’, ‘BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10’ are not available for package ‘ATACCoGAPS’ Perhaps try a variation of: install.packages(c('TFBSTools', 'motifmatchr', 'chromVAR', 'rGREAT', 'JASPAR2016', 'Homo.sapiens', 'Mus.musculus', 'BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19', 'BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10')) * removing ‘/tmp/RtmpkiKXti/Rinstc570d8a7b9bd/ATACCoGAPS’ ----------------------------------- ERROR: package installation failed