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### Running command:
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###   /home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/R/bin/R CMD INSTALL ATACCoGAPS
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* installing to library ‘/home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/R/site-library’
ERROR: dependencies ‘TFBSTools’, ‘motifmatchr’, ‘chromVAR’, ‘rGREAT’, ‘JASPAR2016’, ‘Homo.sapiens’, ‘Mus.musculus’, ‘BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19’, ‘BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10’ are not available for package ‘ATACCoGAPS’
Perhaps try a variation of:
install.packages(c('TFBSTools', 'motifmatchr', 'chromVAR', 'rGREAT', 'JASPAR2016', 'Homo.sapiens', 'Mus.musculus', 'BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19', 'BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10'))
* removing ‘/home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/R/site-library/ATACCoGAPS’