############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r gatom -R && E:\biocbuild\bbs-3.21-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data gatom ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'gatom/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'gatom': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'gatom-tutorial.Rmd' using rmarkdown Quitting from lines 338-340 [unnamed-chunk-28] (gatom-tutorial.Rmd) Error: processing vignette 'gatom-tutorial.Rmd' failed with diagnostics: cannot open the connection to 'http://artyomovlab.wustl.edu/publications/supp_materials/GATOM/network.rhea.rds' --- failed re-building 'gatom-tutorial.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'gatom-tutorial.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted