############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r mnem -R && E:\biocbuild\bbs-3.21-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data mnem ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'mnem/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'mnem': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'mnem.Rmd' using rmarkdown Quitting from mnem.Rmd:158-160 [unnamed-chunk-4] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `plotDnf()`: ! object 'k1' not found --- Backtrace: ▆ 1. ├─base::plot(simmini, data) 2. └─mnem:::plot.mnem_sim(simmini, data) 3. └─mnem::plotDnf(...) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'mnem.Rmd' failed with diagnostics: object 'k1' not found --- failed re-building 'mnem.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'mnem.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted