############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r microSTASIS -R && F:\biocbuild\bbs-3.20-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data microSTASIS ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'microSTASIS/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'microSTASIS': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'microSTASIS.Rmd' using rmarkdown Quitting from microSTASIS.Rmd:189-196 [CV] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: ! BiocParallel errors 0 remote errors, element index: 3 unevaluated and other errors first remote error: --- Backtrace: ▆ 1. ├─BiocParallel::bpmapply(...) 2. └─BiocParallel::bpmapply(...) 3. ├─BiocParallel::bpmapply(...) 4. └─BiocParallel::bpmapply(...) 5. ├─BiocParallel::bplapply(...) 6. └─BiocParallel::bplapply(...) 7. └─BiocParallel:::.bpinit(...) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'microSTASIS.Rmd' failed with diagnostics: BiocParallel errors 0 remote errors, element index: 3 unevaluated and other errors first remote error: --- failed re-building 'microSTASIS.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'microSTASIS.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted