############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/rapidbuild/bbs-3.21-bioc-rapid/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data hpar ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘hpar/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘hpar’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘hpar.Rmd’ using rmarkdown Quitting from hpar.Rmd:320-329 [uc-db] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: ! database or disk is full --- Backtrace: ▆ 1. ├─AnnotationDbi::select(...) 2. └─AnnotationDbi::select(...) 3. └─AnnotationDbi:::.select(...) 4. └─AnnotationDbi:::.legacySelect(x, keys, cols, keytype, jointype) 5. └─AnnotationDbi:::.extractData(...) 6. └─AnnotationDbi:::dbQuery(dbconn(x), sql) 7. ├─DBI::dbGetQuery(conn, SQL) 8. └─DBI::dbGetQuery(conn, SQL) 9. └─DBI (local) .local(conn, statement, ...) 10. ├─DBI::dbSendQuery(conn, statement, ...) 11. └─RSQLite::dbSendQuery(conn, statement, ...) 12. └─RSQLite (local) .local(conn, statement, ...) 13. ├─methods::new(...) 14. │ ├─methods::initialize(value, ...) 15. │ └─methods::initialize(value, ...) 16. └─RSQLite:::result_create(conn@ptr, statement) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'hpar.Rmd' failed with diagnostics: database or disk is full --- failed re-building ‘hpar.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘hpar.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted