Rapid builds (Linux only) of a subset of BioC 3.21
Report updated every 6 hours

This page was generated on 2025-01-26 09:41 -0500 (Sun, 26 Jan 2025).

Approx. Package Snapshot Date/Time (git pull): 2025-01-26 06:00 -0500 (Sun, 26 Jan 2025)
See this page for all the Bioconductor builds and their schedule.

HostnameOSArch (*)R versionInstalled pkgs
teran2Linux (Ubuntu 24.04.1 LTS)x86_64R Under development (unstable) (2025-01-20 r87609) -- "Unsuffered Consequences" 867
Click on any hostname to see more info about the system (e.g. compilers)      (*) as reported by 'uname -p', except on Windows and Mac OS X

Package status is indicated by one of the following glyphs
  TIMEOUT  
 INSTALL, BUILD or CHECK of package took more than 40 minutes
  ERROR  
 Bad DESCRIPTION file, or INSTALL or BUILD of package failed, or CHECK produced errors
  WARNINGS  
 CHECK of package produced warnings
  OK  
 INSTALL, BUILD or CHECK of package went OK
  NA  
 INSTALL, BUILD or CHECK result is not available because of an anomaly in the Build System
skipped
 CHECK of package was skipped because the BUILD step failed
Click on any glyph in the report below to access the detailed report.
QUICK STATSOS / ArchINSTALLBUILDCHECK
teran2Linux (Ubuntu 24.04.1 LTS) / x86_64
01216
09208
01162135
PackageMaintainerINSTALLBUILDCHECK
1/217affxparser 1.79.1  (landing page)Kasper Daniel Hansen  OK    OK    WARNINGS  
2/217affy 1.85.1  (landing page)Robert D. Shear  OK    OK    WARNINGS  
3/217affyio 1.77.3  (landing page)Ben Bolstad  OK    OK    WARNINGS  
4/217affyPLM 1.83.2  (landing page)Ben Bolstad  OK    OK    WARNINGS  
5/217alabaster.base 1.7.4  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    WARNINGS  
6/217alabaster.matrix 1.7.6  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
7/217alabaster.ranges 1.7.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
8/217alabaster.sce 1.7.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
9/217alabaster.schemas 1.7.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
10/217alabaster.se 1.7.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
11/217annotate 1.85.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    ERROR  
12/217AnnotationDbi 1.69.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    WARNINGS  
13/217AnnotationFilter 1.31.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
14/217AnnotationForge 1.49.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
15/217AnnotationHub 3.15.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
16/217AnnotationHubData 1.37.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    WARNINGS  
17/217apeglm 1.29.0  (landing page)Anqi Zhu  OK    OK    OK  
18/217aroma.light 3.37.0  (landing page)Henrik Bengtsson  OK    OK    OK  
19/217assorthead 1.1.13  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
20/217bamsignals 1.39.0  (landing page)Johannes Helmuth  OK    OK    OK  
21/217basilisk 1.19.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
22/217basilisk.utils 1.19.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
23/217batchelor 1.23.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
24/217beachmat 2.23.6  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    WARNINGS  
25/217beachmat.hdf5 1.5.1  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    WARNINGS  
26/217Biobase 2.67.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
27/217BiocBaseUtils 1.9.0  (landing page)Marcel Ramos  OK    OK    OK  
28/217BiocCheck 1.43.2  (landing page)Marcel Ramos  OK    OK    OK  
29/217BiocFileCache 2.15.1  (landing page)Lori Shepherd  OK    OK    OK  
30/217BiocGenerics 0.53.5  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    WARNINGS  
31/217BiocIO 1.17.1  (landing page)Marcel Ramos  OK    OK    OK  
32/217BiocNeighbors 2.1.2  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
33/217BiocParallel 1.41.0  (landing page)Martin Morgan  OK    OK    OK  
34/217BiocSingular 1.23.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    WARNINGS  
35/217BiocStyle 2.35.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
36/217biocthis 1.17.0  (landing page)Leonardo Collado-Torres  OK    OK    OK  
37/217BiocVersion 3.21.1  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
38/217biocViews 1.75.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
39/217biomaRt 2.63.0  (landing page)Mike Smith  OK    OK    ERROR  
40/217biomformat 1.35.0  (landing page)Paul J. McMurdie  OK    OK    OK  
41/217Biostrings 2.75.3  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    WARNINGS  
42/217biovizBase 1.55.0  (landing page)Michael Lawrence  OK    OK    WARNINGS  
43/217bluster 1.17.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
44/217BSgenome 1.75.1  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    WARNINGS  
45/217BSgenomeForge 1.7.0  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    OK  
46/217BumpyMatrix 1.15.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
47/217Category 2.73.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
48/217ChemmineOB 1.45.0  (landing page)Thomas Girke  OK    OK    WARNINGS  
49/217ChemmineR 3.59.0  (landing page)Thomas Girke  OK    OK    WARNINGS  
50/217chihaya 1.7.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    WARNINGS  
51/217clusterProfiler 4.15.1  (landing page)Guangchuang Yu  OK    OK    OK  
52/217ComplexHeatmap 2.23.0  (landing page)Zuguang Gu  OK    OK    OK  
53/217CompoundDb 1.11.2  (landing page)Johannes Rainer  OK    OK    OK  
54/217ConsensusClusterPlus 1.71.0  (landing page)Matt Wilkerson  OK    OK    OK  
55/217csaw 1.41.1  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    ERROR  
56/217cytolib 2.19.2  (landing page)Mike Jiang  OK    OK    WARNINGS  
57/217CytoML 2.19.1  (landing page)Mike Jiang  OK    OK    WARNINGS  
58/217DECIPHER 3.3.2  (landing page)Erik Wright  OK    OK    OK  
59/217DelayedArray 0.33.4  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    WARNINGS  
60/217DelayedMatrixStats 1.29.1  (landing page)Peter Hickey  OK    OK    ERROR  
61/217densvis 1.17.0  (landing page)Alan O'Callaghan  OK    OK    OK  
62/217DESeq2 1.47.1  (landing page)Michael Love  OK    ERROR  skipped
63/217DEXSeq 1.53.0  (landing page)Alejandro Reyes  OK    ERROR  skipped
64/217dir.expiry 1.15.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
65/217DirichletMultinomial 1.49.0  (landing page)Martin Morgan  OK    OK    WARNINGS  
66/217DNAcopy 1.81.0  (landing page)Venkatraman E. Seshan  OK    OK    OK  
67/217DOSE 4.1.0  (landing page)Guangchuang Yu  OK    OK    OK  
68/217DropletUtils 1.27.2  (landing page)Jonathan Griffiths  OK    OK    WARNINGS  
69/217DynDoc 1.85.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    WARNINGS  
70/217EBarrays 2.71.0  (landing page)Ming Yuan  OK    OK    OK  
71/217EBImage 4.49.0  (landing page)Andrzej Oleś  OK    OK    OK  
72/217EDASeq 2.41.0  (landing page)Davide Risso  OK    OK    OK  
73/217edgeR 4.5.2  (landing page)Yunshun Chen , Gordon Smyth , Aaron Lun , Mark Robinson  OK    OK    OK  
74/217eds 1.9.0  (landing page)Avi Srivastava  OK    OK    OK  
75/217EnhancedVolcano 1.25.0  (landing page)Kevin Blighe  OK    ERROR  skipped
76/217EnrichedHeatmap 1.37.0  (landing page)Zuguang Gu  OK    OK    OK  
77/217enrichplot 1.27.4  (landing page)Guangchuang Yu  OK    OK    OK  
78/217ensembldb 2.31.0  (landing page)Johannes Rainer  OK    OK    OK  
79/217ExperimentHub 2.15.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    WARNINGS  
80/217ExperimentHubData 1.33.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    WARNINGS  
81/217fgsea 1.33.2  (landing page)Alexey Sergushichev  OK    OK    OK  
82/217fishpond 2.13.0  (landing page)Michael Love  OK    OK    OK  
83/217flowClust 3.45.0  (landing page)Greg Finak , Mike Jiang  OK    OK    WARNINGS  
84/217flowCore 2.19.0  (landing page)Mike Jiang  OK    OK    WARNINGS  
85/217flowStats 4.19.0  (landing page)Greg Finak , Mike Jiang  OK    OK    WARNINGS  
86/217flowViz 1.71.0  (landing page)Mike Jiang  OK    OK    OK  
87/217flowWorkspace 4.19.0  (landing page)Greg Finak , Mike Jiang  OK    OK    WARNINGS  
88/217fmcsR 1.49.0  (landing page)Thomas Girke  OK    OK    WARNINGS  
89/217gage 2.57.0  (landing page)Weijun Luo  OK    OK    WARNINGS  
90/217gcrma 2.79.0  (landing page)Z. Wu  OK    OK    OK  
91/217gdsfmt 1.43.1  (landing page)Xiuwen Zheng  OK    OK    OK  
92/217genefilter 1.89.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    WARNINGS  
93/217geneplotter 1.85.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
94/217GenomeInfoDb 1.43.4  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    OK  
95/217GenomicAlignments 1.43.0  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    OK  
96/217GenomicFeatures 1.59.1  (landing page)H. Pagès  OK    OK    OK  
97/217GenomicRanges 1.59.1  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    OK  
98/217GEOquery 2.75.0  (landing page)Sean Davis  OK    OK    OK  
99/217ggbio 1.55.0  (landing page)Michael Lawrence  OK    OK    WARNINGS  
100/217ggcyto 1.35.0  (landing page)Mike Jiang  OK    OK    WARNINGS  
101/217ggtree 3.15.0  (landing page)Guangchuang Yu  OK    OK    OK  
102/217ggtreeExtra 1.17.0  (landing page)Shuangbin Xu  OK    OK    OK  
103/217glmGamPoi 1.19.2  (landing page)Constantin Ahlmann-Eltze  OK    OK    OK  
104/217GOSemSim 2.33.0  (landing page)Guangchuang Yu  OK    OK    OK  
105/217GOstats 2.73.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
106/217gpls 1.79.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    WARNINGS  
107/217graph 1.85.1  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    ERROR  
108/217GSEABase 1.69.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
109/217GSVA 2.1.5  (landing page)Robert Castelo  OK    OK    OK  
110/217Gviz 1.51.0  (landing page)Robert Ivanek  OK    OK    OK  
111/217gypsum 1.3.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
112/217h5mread 0.99.4  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    WARNINGS  
113/217HDF5Array 1.35.9  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    OK  
114/217hpar 1.49.0  (landing page)Laurent Gatto  OK    OK    OK  
115/217HubPub 1.15.3  (landing page)Kayla Interdonato  OK    OK    OK  
116/217IHW 1.35.0  (landing page)Nikos Ignatiadis  OK    OK    OK  
117/217illuminaio 0.49.0  (landing page)Kasper Daniel Hansen  OK    OK    OK  
118/217impute 1.81.0  (landing page)Balasubramanian Narasimhan  OK    OK    WARNINGS  
119/217interactiveDisplay 1.45.1  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
120/217interactiveDisplayBase 1.45.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
121/217IRanges 2.41.2  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    ERROR  
122/217karyoploteR 1.33.0  (landing page)Bernat Gel  OK    ERROR  skipped
123/217KEGGgraph 1.67.0  (landing page)Jitao David Zhang  OK    OK    WARNINGS  
124/217keggorthology 2.59.0  (landing page)VJ Carey  OK    OK    OK  
125/217KEGGREST 1.47.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
126/217limma 3.63.3  (landing page)Gordon Smyth  OK    OK    OK  
127/217LoomExperiment 1.25.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
128/217lpsymphony 1.35.0  (landing page)Vladislav Kim  OK    OK    WARNINGS  
129/217maftools 2.23.0  (landing page)Anand Mayakonda  OK    OK    WARNINGS  
130/217MassSpecWavelet 1.73.1  (landing page)Sergio Oller Moreno  OK    OK    OK  
131/217MatrixGenerics 1.19.1  (landing page)Peter Hickey  OK    OK    OK  
132/217mbkmeans 1.23.0  (landing page)Davide Risso  OK    OK    OK  
133/217MetaboCoreUtils 1.15.0  (landing page)Johannes Rainer  OK    OK    OK  
134/217metagenomeSeq 1.49.1  (landing page)Joseph N. Paulson  OK    OK    OK  
135/217metapod 1.15.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
136/217microRNA 1.65.0  (landing page)"James F. Reid"  ERROR    OK    ERROR  
137/217minet 3.65.0  (landing page)Patrick E. Meyer  OK    OK    OK  
138/217MLInterfaces 1.87.0  (landing page)Vincent Carey  OK    OK    WARNINGS  
139/217MsBackendMgf 1.15.2  (landing page)RforMassSpectrometry Package Maintainer  OK    OK    OK  
140/217MsBackendSql 1.7.3  (landing page)Johannes Rainer  OK    OK    OK  
141/217MsCoreUtils 1.19.0  (landing page)RforMassSpectrometry Package Maintainer  OK    OK    OK  
142/217MsDataHub 1.7.0  (landing page)Laurent Gatto  OK    OK    OK  
143/217MsExperiment 1.9.0  (landing page)Laurent Gatto  OK    OK    ERROR  
144/217MsFeatures 1.15.0  (landing page)Johannes Rainer  OK    OK    OK  
145/217MSnbase 2.33.2  (landing page)Laurent Gatto  OK    OK    ERROR  
146/217MultiAssayExperiment 1.33.8  (landing page)Marcel Ramos  OK    OK    ERROR  
147/217multtest 2.63.0  (landing page)Katherine S. Pollard  OK    OK    WARNINGS  
148/217mzID 1.45.0  (landing page)Laurent Gatto  OK    OK    OK  
149/217mzR 2.41.1  (landing page)Steffen Neumann  OK    OK    WARNINGS  
150/217ncdfFlow 2.53.1  (landing page)Mike Jiang  OK    OK    WARNINGS  
151/217openCyto 2.19.0  (landing page)Mike Jiang  OK    OK    WARNINGS  
152/217OrganismDbi 1.49.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK  
153/217pathview 1.47.0  (landing page)Weijun Luo  OK    OK    WARNINGS  
154/217pcaMethods 1.99.0  (landing page)Henning Redestig  OK    OK    OK  
155/217phyloseq 1.51.0  (landing page)Paul J. McMurdie  OK    OK    WARNINGS  
156/217preprocessCore 1.69.0  (landing page)Ben Bolstad  OK    OK    WARNINGS  
157/217pRoloc 1.47.1  (landing page)Laurent Gatto  OK    ERROR  skipped
158/217ProtGenerics 1.39.2  (landing page)Laurent Gatto  OK    OK    OK  
159/217PSMatch 1.11.0  (landing page)Laurent Gatto  OK    OK    OK  
160/217pwalign 1.3.2  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    OK  
161/217QFeatures 1.17.1  (landing page)Laurent Gatto  OK    OK    OK  
162/217qvalue 2.39.0  (landing page)John D. Storey , Andrew J. Bass  OK    OK    OK  
163/217RaggedExperiment 1.31.1  (landing page)Marcel Ramos  OK    OK    OK  
164/217RBGL 1.83.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    WARNINGS  
165/217rBiopaxParser 2.47.0  (landing page)Frank Kramer  OK    OK    OK  
166/217Rdisop 1.67.5  (landing page)Steffen Neumann  OK    OK    WARNINGS  
167/217regioneR 1.39.0  (landing page)Bernat Gel  OK    ERROR  skipped
168/217ReportingTools 2.47.0  (landing page)Jason A. Hackney , Gabriel Becker  OK    OK    ERROR  
169/217ResidualMatrix 1.17.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
170/217Rgraphviz 2.51.0  (landing page)Kasper Daniel Hansen  OK    OK    WARNINGS  
171/217rhdf5 2.51.2  (landing page)Mike Smith  OK    OK    WARNINGS  
172/217rhdf5filters 1.19.0  (landing page)Mike Smith  OK    OK    OK  
173/217Rhdf5lib 1.29.0  (landing page)Mike Smith  OK    OK    WARNINGS  
174/217Rhtslib 3.3.1  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    OK  
175/217ROC 1.83.0  (landing page)Vince Carey  OK    OK    OK  
176/217RProtoBufLib 2.19.0  (landing page)Mike Jiang  OK    OK    WARNINGS  
177/217rpx 2.15.0  (landing page)Laurent Gatto  OK    OK    OK  
178/217Rsamtools 2.23.1  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    WARNINGS  
179/217Rsubread 2.21.1  (landing page)Wei Shi , Yang Liao and Gordon K Smyth  OK    OK    WARNINGS  
180/217rtracklayer 1.67.0  (landing page)Michael Lawrence  OK    ERROR  skipped
181/217S4Arrays 1.7.1  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    OK  
182/217S4Vectors 0.45.2  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    WARNINGS  
183/217ScaledMatrix 1.15.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
184/217scater 1.35.0  (landing page)Alan O'Callaghan  OK    OK    OK  
185/217scran 1.35.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    WARNINGS  
186/217scrapper 1.1.12  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
187/217scuttle 1.17.0  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
188/217seqLogo 1.73.0  (landing page)Robert Ivanek  OK    OK    OK  
189/217sesame 1.25.3  (landing page)Wanding Zhou  OK    OK    OK  
190/217ShortRead 1.65.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    WARNINGS  
191/217SingleCellExperiment 1.29.1  (landing page)Davide Risso  OK    OK    OK  
192/217SingleR 2.9.4  (landing page)Aaron Lun  OK    OK    OK  
193/217snifter 1.17.0  (landing page)Alan O'Callaghan  OK    OK    OK  
194/217snpStats 1.57.0  (landing page)David Clayton  OK    ERROR  skipped
195/217SparseArray 1.7.4  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    OK  
196/217sparseMatrixStats 1.19.0  (landing page)Constantin Ahlmann-Eltze  OK    OK    OK  
197/217SpatialExperiment 1.17.0  (landing page)Dario Righelli  OK    OK    OK  
198/217Spectra 1.17.5  (landing page)RforMassSpectrometry Package Maintainer  OK    OK    OK  
199/217SPIA 2.59.2  (landing page)Adi Laurentiu Tarca  OK    OK    OK  
200/217SummarizedExperiment 1.37.0  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    OK  
201/217supraHex 1.45.1  (landing page)Hai Fang  OK    ERROR  skipped
202/217sva 3.55.0  (landing page)Jeffrey T. Leek , John D. Storey  OK    OK    OK  
203/217TCGAbiolinks 2.35.1  (landing page)Tiago Chedraoui Silva  OK    OK    WARNINGS  
204/217tkWidgets 1.85.0  (landing page)J. Zhang  OK    OK    OK  
205/217treeio 1.31.0  (landing page)Guangchuang Yu  OK    OK    OK  
206/217txdbmaker 1.3.1  (landing page)H. Pagès  OK    OK    OK  
207/217tximeta 1.25.2  (landing page)Michael Love  OK    OK    OK  
208/217tximport 1.35.0  (landing page)Michael Love  OK    OK    OK  
209/217UCSC.utils 1.3.1  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    OK  
210/217VariantAnnotation 1.53.1  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    WARNINGS  
211/217vsn 3.75.0  (landing page)Wolfgang Huber  OK    OK    OK  
212/217widgetTools 1.85.0  (landing page)Jianhua Zhang  OK    OK    OK  
213/217Wrench 1.25.0  (landing page)Hector Corrada Bravo  OK    OK    OK  
214/217xcms 4.5.2  (landing page)Steffen Neumann  OK    OK    OK  
215/217XVector 0.47.2  (landing page)Hervé Pagès  OK    OK    WARNINGS  
216/217zellkonverter 1.17.0  (landing page)Luke Zappia  OK    OK    OK  
217/217zlibbioc 1.53.0  (landing page)Bioconductor Package Maintainer  OK    OK    OK